RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000275820.3

NOM1-201, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOM1, Length 6,077 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-201ENST00000275820 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.95■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 KLHL40Q2TBA0 621 aa21.94■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 CTAGE5O15320 804 aa21.94■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.94■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.93■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 KIAA1328Q86T90 577 aa21.93■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 ZSCAN12O43309 604 aa21.93■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 NAPBQ9H115 298 aa21.93■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.19e-9■■■■■ 111.8
NOM1-201ENST00000275820 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.93■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 FAM193AP78312 1265 aa21.92■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.92■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 KIF18AQ8NI77 898 aa21.92■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.92■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.92■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.92■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.92■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.92■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.91■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.91■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 CCDC102AQ96A19 550 aa21.91■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 PDCL3Q9H2J4 239 aa21.91■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 ZNF213O14771 459 aa21.91■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 C8orf34Q49A92 452 aa21.91■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.91■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 PIK3R4Q99570 1358 aa21.91■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.9■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 FBXO3Q9UK99 471 aa21.9■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 A0A087WZG4 1122 aa21.9■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.9■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 ADCY5O95622 1261 aa21.9■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 FSIP1Q8NA03 581 aa21.9■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 SDSP20132 328 aa21.9■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.9■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.9■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.89■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 KIAA0754O94854 1291 aa21.89■■□□□ 1.1
NOM1-201ENST00000275820 CENPHQ9H3R5 247 aa21.89■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.89■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 TMX3Q96JJ7 454 aa21.88■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 FANCAO15360 1455 aa21.88■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 TNNT1P13805 278 aa21.88■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.88■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 FBLN1P23142 703 aa21.88■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 UBE2HP62256 183 aa21.88■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.87■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 MCM5P33992 734 aa21.87■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 MAP3K12Q12852 859 aa21.87■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.87■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.87■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 ERICH4A6NGS2 130 aa21.87■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 MEIS3Q99687 375 aa21.87■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 URI1O94763 535 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.87■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 USP5P45974 858 aa21.86■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.86■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 STX1AQ16623 288 aa21.86■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 NUP160Q12769 1436 aa21.86■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 GOLIM4O00461 696 aa21.85■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 CASQ1P31415 396 aa21.85■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 CBX1P83916 185 aa21.85■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.85■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 NEMFO60524 1076 aa21.85■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.85■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 CNNM3Q8NE01 707 aa21.85■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 KIF5CO60282 957 aa21.85■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 UVSSAQ2YD98 709 aa21.85■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.85■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 NEK1Q96PY6 1258 aa21.84■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.84■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 TAF4BQ92750 862 aa21.84■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 GBP3Q9H0R5 595 aa21.84■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 FOXO3O43524 673 aa21.84■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.84■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 ACEP12821 1306 aa21.84■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.84■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.84■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 PDE1AP54750 535 aa21.83■■□□□ 1.09
NOM1-201ENST00000275820 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 203.4 ms