RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272317.10

RPS27A-201, Transcript of ribosomal protein S27a, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS27A, Length 1,071 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27A-201ENST00000272317 UTRNP46939 3433 aa21.9■■□□□ 1.1
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RPS27A-201ENST00000272317 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.9■■□□□ 1.1
RPS27A-201ENST00000272317 NARFQ9UHQ1 456 aa21.9■■□□□ 1.1
RPS27A-201ENST00000272317 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
RPS27A-201ENST00000272317 FKBP8Q14318 412 aa21.89■■□□□ 1.09
RPS27A-201ENST00000272317 RUNDC1Q96C34 613 aa21.89■■□□□ 1.09
RPS27A-201ENST00000272317 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.89■■□□□ 1.09
RPS27A-201ENST00000272317 A0A087WZG4 1122 aa21.88■■□□□ 1.09
RPS27A-201ENST00000272317 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.88■■□□□ 1.09
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RPS27A-201ENST00000272317 USP16Q9Y5T5 823 aa21.87■■□□□ 1.09
RPS27A-201ENST00000272317 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
RPS27A-201ENST00000272317 TJP1Q07157 1748 aa21.86■■□□□ 1.09
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RPS27A-201ENST00000272317 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
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RPS27A-201ENST00000272317 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.81■■□□□ 1.08
RPS27A-201ENST00000272317 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.8■■□□□ 1.08
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RPS27A-201ENST00000272317 IFT57Q9NWB7 429 aa21.63■■□□□ 1.05
RPS27A-201ENST00000272317 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.63■■□□□ 1.05
RPS27A-201ENST00000272317 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
RPS27A-201ENST00000272317 NPHP1O15259 732 aa21.62■■□□□ 1.05
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RPS27A-201ENST00000272317 PDIA6Q15084 440 aa21.62■■□□□ 1.05
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