RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172142.7

Nisch-222, Transcript of Nischarin, mouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 2,780 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Smc3	Q9CW03	1217 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Rad50	P70388	1312 aa		27.48	■■□□□ 1.99
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Bcl9	Q9D219	1425 aa		27.48	■■□□□ 1.99
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ier5	O89113	308 aa		27.48	■■□□□ 1.99
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Bms1	Q6PGF5	1284 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Slit2	Q9R1B9	1521 aa		27.47	■■□□□ 1.99
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Wdr93	Q402B2	695 aa		27.47	■■□□□ 1.99
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Bach2	P97303	839 aa		27.47	■■□□□ 1.99
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Samm50	Q8BGH2	469 aa		27.47	■■□□□ 1.99
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Stx6	Q9JKK1	255 aa		27.47	■■□□□ 1.99
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Cct4	P80315	539 aa	Known RBP	27.46	■■□□□ 1.99
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Zfp91	Q62511	572 aa		27.46	■■□□□ 1.99
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Nlgn1	Q99K10	843 aa		27.46	■■□□□ 1.99
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Med4	Q9CQA5	270 aa		27.46	■■□□□ 1.99
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ube2h	P62257	183 aa		27.45	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Adcy5	P84309	1262 aa		27.44	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Hvcn1	Q3U2S8	269 aa		27.44	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Sytl4	Q9R0Q1	673 aa		27.44	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Wdr78	E9PYY5	807 aa		27.44	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Nom1	Q3UFM5	854 aa	Known RBP	27.44	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Nckap5l	Q6GQX2	1323 aa		27.43	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Naa30	Q8CES0	364 aa		27.43	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Utp3	Q9JI13	469 aa	Known RBP	27.43	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Cyp2d12	Q8BVD2	504 aa		27.43	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ccdc178	Q8CDV0	866 aa		27.43	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Srrt	Q99MR6	875 aa	Known RBP	27.43	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Tbc1d31	Q6NXY1	996 aa		27.42	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Rufy3	Q9D394	469 aa		27.42	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Nalcn	Q8BXR5	1738 aa		27.41	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ezr	P26040	586 aa	Known RBP	27.41	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Brf1	Q8CFK2	676 aa		27.41	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Tbc1d30	Q69ZT9	766 aa		27.41	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Tceal9	Q9DD24	104 aa		27.41	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Syt1	P46096	421 aa		27.4	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Zfp51	Q3U4L8	781 aa		27.4	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Top1mt	Q8R4U6	593 aa		27.4	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Scn4a	Q9ER60	1841 aa		27.4	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Kif3a	P28741	701 aa		27.39	■■□□□ 1.98
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Rps6ka5	Q8C050	863 aa		27.39	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Cchcr1	Q8K2I2	770 aa		27.39	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Pnpla7	A2AJ88	1352 aa		27.39	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Brpf1	B2RRD7	1212 aa		27.38	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Msn	P26041	577 aa	Known RBP	27.38	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Babam1	Q3UI43	333 aa		27.38	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Gsdma3	Q5Y4Y6	464 aa		27.38	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Pip4k2b	Q80XI4	416 aa		27.38	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Usp48	Q3V0C5	1052 aa		27.37	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Eapp	Q5BU09	281 aa		27.37	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Rimbp3	Q3V0F0	1606 aa		27.37	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Zfp804b	A0A0G2JGH6	1343 aa		27.37	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Cfdp1	O88271	295 aa	Known RBP	27.37	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Hoxc9	P09633	260 aa		27.37	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Cyp2d11	P24457	504 aa		27.37	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Mcm3	P25206	812 aa	Known RBP	27.37	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Zap70	P43404	618 aa		27.37	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Zscan22	Q8BGS5	496 aa		27.37	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Sf3a1	Q8K4Z5	791 aa	Known RBP	27.37	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Rims2	Q9EQZ7	1530 aa		27.37	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Brwd3	A2AHJ4	1799 aa		27.37	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Tmem94	Q7TSH8	1360 aa		27.37	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	N4bp2	F8VQG7	1678 aa	Known RBP	27.37	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Cnksr1	A2A9K7	700 aa		27.37	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142		Q9D9S1	216 aa		27.36	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Nphp3	Q7TNH6	1325 aa		27.36	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Coil	Q5SU73	570 aa		27.36	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Mad1l1	Q9WTX8	717 aa	Known RBP	27.36	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Myo5b	P21271	1818 aa		27.36	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Exoc6b	A6H5Z3	810 aa		27.35	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ppfia1	B2RXQ2	1266 aa		27.35	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Tlr7	P58681	1050 aa		27.35	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Tti2	Q8BGV4	512 aa		27.35	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Idi1	P58044	227 aa		27.35	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Trpm3	Q5F4S9	1721 aa		27.34	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Cfap73	J3QPZ5	306 aa		27.34	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Map2	P20357	1828 aa		27.34	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ptpn23	Q6PB44	1692 aa		27.34	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Pde3b	Q61409	1100 aa		27.34	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ubr1	O70481	1757 aa		27.33	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Mx2	Q9WVP9	655 aa		27.33	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Rreb1	Q3UH06	1700 aa	Known RBP	27.33	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Lekr1	B2RVN1	116 aa		27.33	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Add2	Q9QYB8	725 aa		27.33	■■□□□ 1.97
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Atg3	Q9CPX6	314 aa		27.32	■■□□□ 1.96
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Pdc	Q9QW08	244 aa		27.32	■■□□□ 1.96
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Camta1	A2A891	1682 aa		27.32	■■□□□ 1.96
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Cavin1	O54724	392 aa		27.32	■■□□□ 1.96
Nisch-222	ENSMUST00000172142	F2r	P30558	430 aa		27.32	■■□□□ 1.96
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Map3k13	Q1HKZ5	959 aa		27.32	■■□□□ 1.96
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Mphosph10	Q810V0	681 aa	Known RBP	27.32	■■□□□ 1.96
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Nup88	Q8CEC0	753 aa	Known RBP	27.32	■■□□□ 1.96
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Zbtb22	Q9Z0G7	638 aa		27.32	■■□□□ 1.96
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Pik3c2a	Q61194	1686 aa		27.32	■■□□□ 1.96
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ifit2	Q64112	472 aa		27.31	■■□□□ 1.96
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Tmem132e	Q6IEE6	982 aa		27.31	■■□□□ 1.96
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Rad17	Q6NXW6	688 aa		27.31	■■□□□ 1.96
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Espnl	Q3UYR4	1005 aa		27.31	■■□□□ 1.96
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Dpyd	Q8CHR6	1025 aa		27.31	■■□□□ 1.96
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Grpel1	Q99LP6	217 aa		27.31	■■□□□ 1.96
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Echdc1	Q9D9V3	322 aa		27.31	■■□□□ 1.96
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Mmel1	Q9JLI3	765 aa		27.31	■■□□□ 1.96

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