RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J CRD1Q07560 283 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J RLF2Q12495 606 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD50P12753 1312 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J SNA3P14359 133 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J TPM1P17536 199 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J TIM23P32897 222 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J SIS2P36024 562 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J UBP11P36026 717 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J ISW1P38144 1129 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J PAN5P38787 379 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J FAF1P40546 346 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J TPO2P53283 614 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J DIP5P53388 608 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J ORC4P54791 529 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J PNG1Q02890 363 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J AIM33Q04516 312 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J TAO3P40468 2376 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J PRC1P00729 532 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J ILV1P00927 576 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J SPT2P06843 333 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J SUP45P12385 437 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J RNR3P21672 869 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J UBC1P21734 215 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J ESS1P22696 170 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J KIN82P25341 720 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC20P28791 383 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J BRL1P38770 471 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J YEL025CP39991 1188 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J HMF1P40037 129 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J PCI8P40512 444 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J SPO74P45819 413 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J INP52P50942 1183 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J GCR2Q01722 534 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J MUK1Q02866 612 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J CSM3Q04659 317 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J MAG2Q06436 670 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J WHI4Q07655 649 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J TFC8Q12308 588 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR117WQ06116 2489 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J IDI1P15496 288 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS1P21576 704 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J AFT1P22149 690 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J SWI4P25302 1093 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J FUB1P25659 250 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J URK1P27515 501 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J CLB5P30283 435 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J MSS51P32335 436 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J SMY2P32909 740 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J RDH54P38086 958 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J RXT2P38255 430 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J RPN10P38886 268 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J CCT3P39077 534 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J VID30P53076 958 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J ZPR1P53303 486 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J DSE4P53753 1117 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J BNI5P53890 448 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J TRS120Q04183 1289 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J HSP82P02829 709 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J DED1P06634 604 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC6P09119 513 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J CLN3P13365 580 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J MAK11P20484 414 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J GSY1P23337 708 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J ADK2P26364 225 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J SUV3P32580 737 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J FBP26P32604 452 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX2P32800 271 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG19P35193 415 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J POA1P38218 177 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J EAF5P39995 279 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J OPT1P40897 799 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J CIT3P43635 486 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J GCV2P49095 1034 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J MDR1P53258 950 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J HEH2Q03281 663 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J SPO71Q03868 1245 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J LCD1Q04377 747 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J EIS1Q05050 843 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J DAP1Q12091 152 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J TSR3Q12094 313 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J PGK1P00560 416 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J TUF1P02992 437 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J ADE4P04046 510 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data2.96□□□□□ -1.94not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J CSE2P33308 149 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J PGM1P33401 570 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J SAS3P34218 831 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J BMH2P34730 273 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J GCS1P35197 352 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J MNR2P35724 969 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J APN2P38207 520 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J PCM1P38628 557 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J GAA1P39012 614 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J RPN3P40016 523 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J AIM9P40053 627 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG32P40458 529 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J GPD2P41911 440 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
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