RNA–Protein interactions for RNA: YOR117W

RPT5, Transcript of ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome, yeast

Gene RPT5, Length 1,305 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPT5	YOR117W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	APC11	Q12157	165 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	MYO1	P08964	1928 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	ROX1	P25042	368 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	SHP1	P34223	423 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	ATG1	P53104	897 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	YGR273C	P53329	174 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	AIM33	Q04516	312 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	SGD1	Q06132	899 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	MMR1	Q06324	491 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	ARP6	Q12509	438 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	ORC6	P38826	435 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	ATG32	P40458	529 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	YAP5	P40574	245 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	MFM1	Q02783	413 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	GSY1	P23337	708 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	ISW1	P38144	1129 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	GAA1	P39012	614 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	ORC4	P54791	529 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	TOM1	Q03280	3268 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	SEC8	P32855	1065 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	VPS29	P38759	282 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	DAK2	P43550	591 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	YGR153W	P48238	217 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	DUS4	Q06063	367 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	ERP3	Q12403	225 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	DID4	P36108	232 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	YPT11	P48559	417 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	SLD5	Q03406	294 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	YLH47	Q06493	454 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	WSC3	Q12215	556 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	SMC6	Q12749	1114 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPT5	YOR117W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	RPN12	P32496	274 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	REG2	P38232	338 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	MXR1	P40029	184 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	NCS6	P53088	359 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	HUL5	P53119	910 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	GPA1	P08539	472 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	OXP1	P28273	1286 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	CLB5	P30283	435 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	RGT1	P32862	1170 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	YER130C	P39959	443 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	THI6	P41835	540 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	ROG3	P43602	733 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	UBA2	P52488	636 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	PHM6	Q05637	104 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	FOB1	O13329	566 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	CKA2	P19454	339 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	TFC4	P33339	1025 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	CBK1	P53894	756 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	MET7	Q08645	548 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.11	□□□□□ -0.79	not detected
RPT5	YOR117W	VTC2	P43585	828 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	VPS53	P47061	822 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	CTR1	P49573	406 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	UBP15	P50101	1230 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	ADY4	Q05955	493 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	TRS33	Q99394	268 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	ESS1	P22696	170 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	HIR1	P32479	840 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	UBP11	P36026	717 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	PET10	P36139	283 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79

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