RNA–Protein interactions for RNA: YMR139W

RIM11, Transcript of Protein kinase, yeast

Gene RIM11, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM11	YMR139W	SPT20	P50875	604 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RIM11	YMR139W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
RIM11	YMR139W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RIM11	YMR139W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RIM11	YMR139W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RIM11	YMR139W	MDL2	P33311	773 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM11	YMR139W	YAR028W	P39548	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM11	YMR139W	NUT1	P53114	1132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM11	YMR139W	BSC2	Q05611	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM11	YMR139W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM11	YMR139W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RIM11	YMR139W	FLP1	P03870	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM11	YMR139W	YPT53	P36019	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM11	YMR139W	TAT2	P38967	592 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM11	YMR139W	QDR1	P40475	563 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM11	YMR139W	SAP155	P43612	1002 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM11	YMR139W	YNL011C	P53980	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM11	YMR139W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RIM11	YMR139W	MON1	P53129	644 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	MET5	P47169	1442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	KAR5	Q04746	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	DOP1	Q03921	1698 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	EXO5	P38289	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	NEM1	P38757	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	MET10	P39692	1035 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	YNR063W	P53749	607 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	SPS1	P08458	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	ATG14	P38270	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	HSE1	P38753	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	SHU2	P38957	223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	SGD1	Q06132	899 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	TRM2	P33753	639 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	LAM1	P38851	1228 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	LAP2	Q10740	671 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	PUS9	Q12069	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	VMR1	P38735	1592 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	MEF2	P39677	819 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	YJL045W	P47052	634 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	GCN5	Q03330	439 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIM11	YMR139W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	MSE1	P48525	536 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	CDC55	Q00362	526 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	ROT1	Q03691	256 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	RSC58	Q07979	502 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	YML122C	Q03207	126 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	XKS1	P42826	600 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	MNL2	Q12205	849 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	LTE1	P07866	1435 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	ENV11	P53246	860 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	BNR1	P40450	1375 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	IML1	P47170	1584 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	SPT7	P35177	1332 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
RIM11	YMR139W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	SLI1	P53304	468 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	SUN4	P53616	420 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	PEX13	P80667	386 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	NUP192	P47054	1683 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	HCM1	P25364	564 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	YSC84	P32793	468 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	DNF2	Q12675	1612 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	MHP1	P43638	1398 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RIM11	YMR139W	MSH3	P25336	1018 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RIM11	YMR139W	ACF4	P47129	309 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RIM11	YMR139W	ATG1	P53104	897 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RIM11	YMR139W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RIM11	YMR139W	PAF1	P38351	445 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RIM11	YMR139W	PDR11	P40550	1411 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RIM11	YMR139W	HNT2	P49775	206 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RIM11	YMR139W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RIM11	YMR139W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RIM11	YMR139W	RAV1	P47104	1357 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RIM11	YMR139W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RIM11	YMR139W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RIM11	YMR139W	PLB2	Q03674	706 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RIM11	YMR139W	RSB1	Q08417	382 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RIM11	YMR139W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RIM11	YMR139W	COQ4	O13525	335 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RIM11	YMR139W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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