RNA–Protein interactions for RNA: YLR466W

YRF1-4, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeast

Gene YRF1-4, Length 4,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRF1-4	YLR466W	CEP3	P40969	608 aa		6.29	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	VPS53	P47061	822 aa		6.29	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	TMA16	Q08687	178 aa		6.29	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	PTC5	Q12511	572 aa		6.29	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	CHS3	P29465	1165 aa		6.29	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	HIR1	P32479	840 aa		6.29	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	STV1	P37296	890 aa		6.29	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	NDC80	P40460	691 aa		6.29	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	CBK1	P53894	756 aa		6.29	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	NSG2	P53898	299 aa		6.29	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	ATG9	Q12142	997 aa		6.29	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	PSO2	P30620	661 aa		6.29	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	VPS38	Q05919	439 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	TFC8	Q12308	588 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	FIG2	P25653	1609 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	BCD1	P38772	366 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	ORC6	P38826	435 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	QCR6	P00127	147 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	CKA2	P19454	339 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	VPS35	P34110	944 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	YET1	P35723	206 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	EFM2	P38347	419 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	DAK2	P43550	591 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	ATG1	P53104	897 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	PMD1	P32634	1753 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	RPC53	P25441	422 aa		6.27	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	MFM1	Q02783	413 aa		6.27	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	RBA50	Q04418	439 aa		6.27	□□□□□ -1.4
YRF1-4	YLR466W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	ASE1	P50275	885 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	MTC3	P53077	123 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	AIM33	Q04516	312 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	MTF2	P10849	440 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	PSY4	P38193	441 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	SGM1	P47166	707 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	SKG3	Q06315	1026 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	PLP2	Q12017	286 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	CSR2	Q12734	1121 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	SRB4	P32569	687 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	ATG19	P35193	415 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	CIT3	P43635	486 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	YGR237C	P50089	785 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	YML037C	Q03703	340 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	SPO75	Q07798	868 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	OXR1	Q08952	273 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	PHO13	P19881	312 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	RAM2	P29703	316 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	PET10	P36139	283 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	YGR153W	P48238	217 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	PEX29	Q03370	554 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	TY3A-G	Q12173	290 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	TY3A-I	Q99219	290 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	FOB1	O13329	566 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	SEC8	P32855	1065 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	SUL1	P38359	859 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	RTT107	P38850	1070 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	YFL034W	P43564	1073 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	YGR273C	P53329	174 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	YAP7	Q08182	245 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	PET111	P08468	800 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	NIP100	P33420	868 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	ISW1	P38144	1129 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	YJL171C	P46992	396 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	FMS1	P50264	508 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	APL4	Q12028	832 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	YAP5	P40574	245 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	LIF1	P53150	421 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	ADY4	Q05955	493 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	COG4	Q06096	861 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	FLO1	P32768	1537 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	LTV1	P34078	463 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	PPS1	P38148	807 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	GPB2	P39717	880 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	ATG32	P40458	529 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	TOS3	P43637	560 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	NET1	P47035	1189 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	COS5	P47187	383 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	YPL216W	Q08964	1102 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-4	YLR466W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 66.6 ms