RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W MAE1P36013 669 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W SAF1P38352 637 aa3.08□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W YIG1Q08956 461 aa3.08□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W NYV1Q12255 253 aa3.08□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W CMR1Q12510 522 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W VPS13Q07878 3144 aa3.07□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W LEU2P04173 364 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W THS1P04801 734 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W GRS1P38088 690 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W NEO1P40527 1151 aa3.07□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W NCE103P53615 221 aa3.07□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W FAR11P53917 953 aa3.07□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W SIR4P11978 1358 aa3.07□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W FLP1P03870 423 aa3.07□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W RET1P22276 1149 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W ESL2P36168 1195 aa3.07□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W MTR4P47047 1073 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W GCV1P48015 400 aa3.07□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W MEC3Q02574 474 aa3.07□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W NUT2Q06213 157 aa3.07□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W HAT1Q12341 374 aa3.07□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W FRT1Q99332 602 aa3.07□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W CHS2P14180 963 aa3.06□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W ERS1P17261 260 aa3.06□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W NPR1P22211 790 aa3.06□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W YML020WQ03722 664 aa3.06□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W YLL066CQ99208 1374 aa3.06□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W HTS1P07263 546 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W DUR3P33413 735 aa3.05□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W AKR1P39010 764 aa3.05□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W RRT14P40470 206 aa3.05□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W PMT7Q06644 662 aa3.05□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data3.05□□□□□ -1.92not detected
SSQ1YLR369W YOR223WQ12015 292 aa3.05□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W YLL054CQ12244 843 aa3.05□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W FAS2P19097 1887 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W TOP1P04786 769 aa3.05□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W YCR015CP25616 317 aa3.05□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W SMY1P32364 656 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W ECM2P38241 364 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W PPX1P38698 397 aa3.05□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W SAM37P50110 327 aa3.05□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W GPI13Q07830 1017 aa3.05□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W YLL067CQ07888 1374 aa3.04□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W CYC7P00045 113 aa3.04□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W GRX1P25373 110 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W ARL1P38116 183 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W YHL008CP38750 627 aa3.04□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W CIC1P38779 376 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W YIL089WP40500 205 aa3.04□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W KIP3P53086 805 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W NUT1P53114 1132 aa3.04□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W ATG13Q06628 738 aa3.04□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W SPE2P21182 396 aa3.03□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W MSB1P21339 1137 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W ICL1P28240 557 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W NAM7P30771 971 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W STM1P39015 273 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W SPO74P45819 413 aa3.03□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W YAF9P53930 226 aa3.03□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W FIG2P25653 1609 aa3.03□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W YML133CQ03099 1374 aa3.03□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W OSM1P21375 501 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W PAM1P37304 830 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W MAL31P38156 614 aa3.03□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W PFF1P38244 976 aa3.03□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W YHL050CP38721 697 aa3.03□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W YHR219WP38900 624 aa3.03□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W RVS167P39743 482 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W NOP7P53261 605 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W CTI6Q08923 506 aa3.03□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W GCD6P32501 712 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W SHC1P39000 512 aa3.02□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W INP54Q08227 384 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W VPS35P34110 944 aa3.01□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W SEG2P34250 1132 aa3.01□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W YCS4Q06156 1176 aa3.01□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W GIC2Q06648 383 aa3.01□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W PMD1P32634 1753 aa3.01□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W RPS9BP05755 195 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W PHO4P07270 312 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W SHU2P38957 223 aa3.01□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W NOG1Q02892 647 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W DOT1Q04089 582 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W MSC6Q08818 692 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W TY1A-DR6P0CX70 440 aa3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W TY1A-ER1P0CX71 440 aa3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W TY1A-LR2P0CX72 440 aa3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W TY1A-PLP0CX73 440 aa3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W TY1A-JR1P0CX74 440 aa3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W TY1A-LR3P0CX75 440 aa3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W TY1A-ML2P0CX76 440 aa3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W SEC20P28791 383 aa3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W EXO5P38289 585 aa3□□□□□ -1.93
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