RNA–Protein interactions for RNA: YKR033C

YKR033C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR033C, Length 426 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR033CYKR033C OMA1P36163 345 aa3.58□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C STM1P39015 273 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C SPO74P45819 413 aa3.58□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C YGR045CP53229 120 aa3.58□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C NOG1Q02892 647 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C DOT1Q04089 582 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C YMR074CQ04773 145 aa3.58□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C GIC2Q06648 383 aa3.58□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C YOR223WQ12015 292 aa3.58□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C GCD1P09032 578 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data3.57□□□□□ -1.84not detected
YKR033CYKR033C VPS35P34110 944 aa3.57□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C REI1P38344 393 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C MTR4P47047 1073 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C ULP1Q02724 621 aa3.57□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C TAP42Q04372 366 aa3.57□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C MAG2Q06436 670 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C MED7Q08278 222 aa3.57□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C RAD9P14737 1309 aa3.56□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C CYC7P00045 113 aa3.56□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C LEU2P04173 364 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C TOS1P38288 455 aa3.56□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C FAA3P39002 694 aa3.56□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C PIC2P40035 300 aa3.56□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C MSH4P40965 878 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C DAL4Q04895 635 aa3.56□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C BRE4Q07660 1125 aa3.56□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C HXK1P04806 485 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C ATE1P16639 503 aa3.55□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C MSB1P21339 1137 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C MSH3P25336 1018 aa3.55□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C WHI3P34761 661 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C RDH54P38086 958 aa3.55□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C CIC1P38779 376 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C ELA1P53861 379 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C RIA1P53893 1110 aa3.55□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C SDH1Q00711 640 aa3.55□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C YPL109CQ02981 657 aa3.55□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C YML020WQ03722 664 aa3.55□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C UTP5Q04177 643 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C MAC1P35192 417 aa3.54□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C ARL1P38116 183 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C VPS27P40343 622 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C ALT1P52893 592 aa3.54□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C PRP43P53131 767 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C YNR029CP53729 429 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C CDC45Q08032 650 aa3.54□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C KRE5P22023 1365 aa3.53□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C KAR2P16474 682 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C GCD6P32501 712 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C PEX28P38848 579 aa3.53□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C OYE3P41816 400 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C THI12P42883 340 aa3.53□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C THI5P43534 340 aa3.53□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C THI11P47183 340 aa3.53□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C YGL140CP53120 1219 aa3.53□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C ORC1P54784 914 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C THI13Q07748 340 aa3.53□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C YLL054CQ12244 843 aa3.53□□□□□ -1.84
YKR033CYKR033C ADE6P38972 1358 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C YML133CQ03099 1374 aa3.52□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C YLL067CQ07888 1374 aa3.52□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C YLL066CQ99208 1374 aa3.52□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C SEC20P28791 383 aa3.52□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C RPT1P33299 467 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C YKL077WP36081 392 aa3.52□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C PEX7P39108 375 aa3.52□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C NOP2P40991 618 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C MMM1P41800 426 aa3.52□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C PEX13P80667 386 aa3.52□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C YVC1Q12324 675 aa3.52□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C YRF1-4O13559 1382 aa3.51□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C MCM2P29469 868 aa3.51□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C AFG2P32794 780 aa3.51□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C PRS1P32895 427 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C LRG1P35688 1017 aa3.51□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C NMD3P38861 518 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C FPR3P38911 411 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C RCM1P53972 490 aa3.51□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C CTF4Q01454 927 aa3.51□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C ADI1Q03677 179 aa3.51□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C RPO41P13433 1351 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C NFS1P25374 497 aa3.5□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C LIP5P32875 414 aa3.5□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C SMY2P32909 740 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C FYV10P40492 516 aa3.5□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C XKS1P42826 600 aa3.5□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data3.5□□□□□ -1.85not detected
YKR033CYKR033C CIT3P43635 486 aa3.5□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C YJR107WP47145 328 aa3.5□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C AVO1Q08236 1176 aa3.5□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C SEC23P15303 768 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C VMA4P22203 233 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
YKR033CYKR033C RET1P22276 1149 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 135.9 ms