RNA–Protein interactions for RNA: YKR011C

YKR011C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKR011C, Length 1,062 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR011C	YKR011C	PTC7	P38797	343 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YKR011C	YKR011C	GPB2	P39717	880 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YKR011C	YKR011C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	MET10	P39692	1035 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	GTS1	P40956	396 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	SPO21	Q12411	609 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	COQ4	O13525	335 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	YCR015C	P25616	317 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	MLS1	P30952	554 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	BAP2	P38084	609 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	MPH1	P40562	993 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	TNA1	P53322	534 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	EEB1	Q02891	456 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	YKL222C	P35995	705 aa		5	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	CLN2	P20438	545 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	LYP1	P32487	611 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	CCZ1	P38273	704 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	MAD1	P40957	749 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	HNT2	P49775	206 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
YKR011C	YKR011C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
YKR011C	YKR011C	RSC58	Q07979	502 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	YER152C	P10356	443 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	SNF5	P18480	905 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
YKR011C	YKR011C	PIK1	P39104	1066 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	TYW3	P53177	273 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	YGR053C	P53234	283 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	VPS16	Q03308	798 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	PIN2	Q12057	282 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	AIM26	P32858	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	CDA2	Q06703	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	GNT1	Q12096	491 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR011C	YKR011C	INO1	P11986	533 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	MCM7	P38132	845 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	ESC8	Q08119	714 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	SPS1	P08458	490 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	YFL054C	P43549	646 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	SPO20	Q04359	397 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	TAF1	P46677	1066 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	CWC24	P53769	259 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	RSB1	Q08417	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	RKM4	Q12504	494 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	YKL107W	P34251	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	PNT1	P38969	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	MXR1	P40029	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	ENV11	P53246	860 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	BAS1	P22035	811 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	GEM1	P39722	662 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	GIP4	P39732	760 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	YGL176C	P46945	554 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	ACM1	Q08981	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR011C	YKR011C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	MRPL22	P53881	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	ESC2	Q06340	456 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	ATG13	Q06628	738 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	OPI10	Q08202	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	SLA2	P33338	968 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
YKR011C	YKR011C	THI80	P35202	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	UGA2	P38067	497 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	VAC8	P39968	578 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	AGP1	P25376	633 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	RFC5	P38251	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	SNO2	P53823	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	SVS1	Q12254	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR011C	YKR011C	BI4	P03879	638 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39.2 ms