RNA–Protein interactions for RNA: YKL209C

STE6, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene STE6, Length 3,873 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STE6	YKL209C	DIT2	P21595	489 aa		3.57	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	XRS2	P33301	854 aa		3.57	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	NPL4	P33755	580 aa		3.57	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	FMP10	P40098	244 aa		3.57	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.57	□□□□□ -1.84	not detected
STE6	YKL209C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	MAK31	P23059	88 aa		3.57	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	VPS3	P23643	1011 aa		3.57	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	VID28	P40547	921 aa		3.57	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	YGR273C	P53329	174 aa		3.57	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	SKY1	Q03656	742 aa		3.57	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	NUC1	P08466	329 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	OPI1	P21957	404 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	DSE4	P53753	1117 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	TLG2	Q08144	397 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.56	□□□□□ -1.84	RIP-Chip
STE6	YKL209C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	PDE1	P22434	369 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	PEP3	P27801	918 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	TIM23	P32897	222 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	YJL171C	P46992	396 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	AIM33	Q04516	312 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	YML083C	Q04526	418 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	SPH1	Q06160	661 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	ECM30	Q06673	1274 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	TAF10	Q12030	206 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	REC8	Q12188	680 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	SMC6	Q12749	1114 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	CIT2	P08679	460 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	FUS1	P11710	512 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	WHI2	P12611	486 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.56	□□□□□ -1.84	not detected
STE6	YKL209C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.56	□□□□□ -1.84	not detected
STE6	YKL209C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	MMR1	Q06324	491 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	3.55	□□□□□ -1.84	RIP-Chip
STE6	YKL209C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.55	□□□□□ -1.84	RIP-Chip
STE6	YKL209C	PEX14	P53112	341 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	PIB2	P53191	635 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	GDE1	Q02979	1223 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	YOR111W	Q99210	232 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	TVP38	P36164	337 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	HXT5	P38695	592 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	YEL025C	P39991	1188 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	LAM5	P43560	674 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	VTC2	P43585	828 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	VTC4	P47075	721 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	MRPS35	P53292	345 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	RIM20	Q12033	661 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	ERP3	Q12403	225 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	RAD50	P12753	1312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	CSE2	P33308	149 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	GCV2	P49095	1034 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	MET13	P53128	600 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	RTC4	P53850	401 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	TFC6	Q06339	672 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	OSH2	Q12451	1283 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.54	□□□□□ -1.84	not detected
STE6	YKL209C	RAM2	P29703	316 aa		3.54	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	MSS51	P32335	436 aa		3.54	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	RPC53	P25441	422 aa		3.54	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	APM2	P38700	605 aa		3.54	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	TBF1	Q02457	562 aa		3.54	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	HFI1	Q12060	488 aa		3.54	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	UBP13	P38187	747 aa		3.54	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	BRL1	P38770	471 aa		3.54	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	AKR1	P39010	764 aa		3.54	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	ESL1	P40456	1118 aa		3.54	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	EPL1	P43572	832 aa		3.54	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	NSE5	Q03718	556 aa		3.54	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	BCS1	P32839	456 aa		3.53	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	ARP6	Q12509	438 aa		3.53	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	SUV3	P32580	737 aa		3.53	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	CCL1	P37366	393 aa		3.53	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	FLR1	P38124	548 aa		3.53	□□□□□ -1.84
STE6	YKL209C	VPS29	P38759	282 aa		3.53	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 38.1 ms