RNA–Protein interactions for RNA: YKL156W

RPS27A, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS27A, Length 249 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS27A	YKL156W	DFG16	Q99234	619 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPS27A	YKL156W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.17	□□□□□ -1.9	RIP-Chip
RPS27A	YKL156W	PRO1	P32264	428 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPS27A	YKL156W	HSP78	P33416	811 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPS27A	YKL156W	PET112	P33893	541 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPS27A	YKL156W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RPS27A	YKL156W	YKL069W	P36088	180 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPS27A	YKL156W	GTS1	P40956	396 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPS27A	YKL156W	ENT3	P47160	408 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPS27A	YKL156W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RPS27A	YKL156W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RPS27A	YKL156W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RPS27A	YKL156W	YKL151C	P36059	337 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPS27A	YKL156W	MXR1	P40029	184 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPS27A	YKL156W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RPS27A	YKL156W	CNN1	P43618	361 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPS27A	YKL156W	VPS53	P47061	822 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPS27A	YKL156W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RPS27A	YKL156W	LAP2	Q10740	671 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPS27A	YKL156W	PIN2	Q12057	282 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPS27A	YKL156W	ADP1	P25371	1049 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	LYP1	P32487	611 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	MNR2	P35724	969 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	YHL012W	P38709	493 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	RSC58	Q07979	502 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	SRM1	P21827	482 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	RGD1	P38339	666 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	HSE1	P38753	452 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	TAT2	P38967	592 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	PNT1	P38969	423 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	MTC3	P53077	123 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	TYW3	P53177	273 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	GDE1	Q02979	1223 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	CDA2	Q06703	312 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	INO1	P11986	533 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	MDL2	P33311	773 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	TNA1	P53322	534 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	YPL260W	Q08977	551 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	PRI2	P20457	528 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	YCR015C	P25616	317 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	STE5	P32917	917 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	SLA2	P33338	968 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	THI80	P35202	319 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	MBP1	P39678	833 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	NPP2	P39997	493 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	YGL176C	P46945	554 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	PLB2	Q03674	706 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	OPI10	Q08202	246 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	BAS1	P22035	811 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	RAD27	P26793	382 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	AIM26	P32858	118 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	MCM7	P38132	845 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	PIK1	P39104	1066 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	HRQ1	Q05549	1077 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	XYL2	Q07993	356 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	GNT1	Q12096	491 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	VBA5	P36172	582 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	ATG14	P38270	344 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	VAC8	P39968	578 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	HNT2	P49775	206 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	ESC8	Q08119	714 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	BI4	P03879	638 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	YKL222C	P35995	705 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	UGA2	P38067	497 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	HFM1	P51979	1187 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.09	□□□□□ -1.91	not detected
RPS27A	YKL156W	SVF1	Q05515	481 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPS27A	YKL156W	COQ4	O13525	335 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPS27A	YKL156W	AGP1	P25376	633 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPS27A	YKL156W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RPS27A	YKL156W	MAD1	P40957	749 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPS27A	YKL156W	MRPL22	P53881	309 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPS27A	YKL156W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.08	□□□□□ -1.92	not detected
RPS27A	YKL156W	YDR132C	Q03900	495 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPS27A	YKL156W	ATG13	Q06628	738 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPS27A	YKL156W	RKM4	Q12504	494 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPS27A	YKL156W	SPS1	P08458	490 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPS27A	YKL156W	CDC6	P09119	513 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPS27A	YKL156W	ACE2	P21192	770 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPS27A	YKL156W	AFR1	P33304	620 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPS27A	YKL156W	ERT1	P38140	529 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPS27A	YKL156W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RPS27A	YKL156W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RPS27A	YKL156W	TAF1	P46677	1066 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPS27A	YKL156W	CWC24	P53769	259 aa		3.07	□□□□□ -1.92

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