RNA–Protein interactions for RNA: YHR203C

RPS4B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS4B, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS4B	YHR203C	SUT2	Q12286	268 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	TTI1	P36097	1038 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	VPS8	P39702	1274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	RAD61	Q99359	647 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	PEP12	P32854	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	MSC7	P38694	644 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	VID27	P40157	782 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	ATG3	P40344	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	VPS53	P47061	822 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	TAH18	Q12181	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	ECM29	P38737	1868 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RPS4B	YHR203C	AFT1	P22149	690 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	MKS1	P34072	584 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	SOH1	P38633	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	POL32	P47110	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	KAR5	Q04746	504 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	DUS4	Q06063	367 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	RAD18	P10862	487 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	FBP26	P32604	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	DLD1	P32891	587 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	SIS2	P36024	562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	HST3	P53687	447 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	COQ1	P18900	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	OPI1	P21957	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	SEC20	P28791	383 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	UTR4	P32626	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	SEC8	P32855	1065 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	TIM23	P32897	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	GPT2	P36148	743 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	MET1	P36150	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	VPS45	P38932	577 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	SLD5	Q03406	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	TUS1	Q06412	1307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	ACE2	P21192	770 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	CHS3	P29465	1165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	KTR7	P40504	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	LSB1	P53281	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	FOL1	P53848	824 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	UFD2	P54860	961 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	ISU1	Q03020	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	DFG5	Q05031	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	AHC1	Q12433	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	IRE1	P32361	1115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	KTR2	P33550	425 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	YHL050C	P38721	697 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	AFG3	P39925	761 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	SKP2	P42843	763 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	PIB2	P53191	635 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	VPS30	Q02948	557 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	RTP1	Q12751	981 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	CDC16	P09798	840 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	STE6	P12866	1290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	MIP1	P15801	1254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	RIT1	P23796	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	BCS1	P32839	456 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	TFC4	P33339	1025 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	TGL4	P36165	910 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	ALG2	P43636	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	YJR115W	P47152	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	MRPS35	P53292	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS4B	YHR203C	SPH1	Q06160	661 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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