RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	PSF3	Q12146	194 aa		7	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	CTT1	P06115	562 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	NPR3	P38742	1146 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	VID27	P40157	782 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	NUP85	P46673	744 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	APL6	P46682	809 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	YPL260W	Q08977	551 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	YOR111W	Q99210	232 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	TOP1	P04786	769 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	YKU70	P32807	602 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	MKS1	P34072	584 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	YPR084W	Q06821	456 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	RAD61	Q99359	647 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	CDC6	P09119	513 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	YER130C	P39959	443 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	FRA1	Q07825	749 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	DCS2	Q12123	353 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	GPA1	P08539	472 aa		6.97	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	RGP1	P16664	663 aa		6.97	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	CBP3	P21560	335 aa		6.97	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	MAK31	P23059	88 aa		6.97	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	AFG2	P32794	780 aa		6.97	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	SGD1	Q06132	899 aa		6.97	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	PKC1	P24583	1151 aa		6.96	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	ATE1	P16639	503 aa		6.95	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	ACE2	P21192	770 aa		6.95	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	MCM2	P29469	868 aa		6.95	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	RXT2	P38255	430 aa		6.95	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	FYV10	P40492	516 aa		6.95	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	PCI8	P40512	444 aa		6.95	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	YPT11	P48559	417 aa		6.95	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	MRPL10	P36520	322 aa		6.94	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	STV1	P37296	890 aa		6.94	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	MAL31	P38156	614 aa		6.94	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	VPS8	P39702	1274 aa		6.94	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	AAD14	P42884	376 aa		6.94	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	LSC2	P53312	427 aa		6.94	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	ATG20	Q07528	640 aa		6.94	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	BDS1	Q08347	646 aa		6.94	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	MIC60	P36112	540 aa		6.94	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	GIS4	Q04233	774 aa		6.94	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.93	□□□□□ -1.3	not detected
YCK1	YHR135C	ATG3	P40344	310 aa		6.93	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	ALG2	P43636	503 aa		6.93	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	YPL062W	Q02781	134 aa		6.93	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	GDE1	Q02979	1223 aa		6.93	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	OPT2	Q06593	877 aa		6.93	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	MCM16	Q12262	181 aa		6.93	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	PTC5	Q12511	572 aa		6.93	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	CHS3	P29465	1165 aa		6.92	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	EMP47	P43555	445 aa		6.92	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	VPS4	P52917	437 aa		6.92	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	DFG5	Q05031	458 aa		6.92	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	CIT1	P00890	479 aa		6.91	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	MIP1	P15801	1254 aa		6.91	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	GSY2	P27472	705 aa		6.91	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	RRM3	P38766	723 aa		6.91	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	SHC1	P39000	512 aa		6.91	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	RGA1	P39083	1007 aa		6.91	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	STE6	P12866	1290 aa		6.9	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	SRM1	P21827	482 aa		6.9	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	PRE8	P23639	250 aa		6.9	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	MTC3	P53077	123 aa		6.9	□□□□□ -1.3
YCK1	YHR135C	UBP2	Q01476	1272 aa		6.9	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 109.9 ms