RNA–Protein interactions for RNA: YHR048W

YHK8, Transcript of Presumed antiporter of the major facilitator superfamily, yeastyeast

Gene YHK8, Length 1,545 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHK8YHR048W ISW1P38144 1129 aa7.32□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W TMA64Q04600 565 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W YLH47Q06493 454 aa7.32□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W OXR1Q08952 273 aa7.32□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W APC11Q12157 165 aa7.32□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W SMC6Q12749 1114 aa7.32□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W TAF13P11747 167 aa7.31□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W FRS2P15625 503 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W CKA2P19454 339 aa7.31□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W URA1P28272 314 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W RPN12P32496 274 aa7.31□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W UTR4P32626 227 aa7.31□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W RVS167P39743 482 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W MXR1P40029 184 aa7.31□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W DAK2P43550 591 aa7.31□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W ROG3P43602 733 aa7.31□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W HIS4P00815 799 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W TUF1P02992 437 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W CLB5P30283 435 aa7.3□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W RGT1P32862 1170 aa7.3□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W TIM23P32897 222 aa7.3□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W GAA1P39012 614 aa7.3□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W CIT3P43635 486 aa7.3□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W VPS53P47061 822 aa7.3□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W YPT11P48559 417 aa7.3□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W DUS1P53759 423 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W AIM33Q04516 312 aa7.3□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W PHM6Q05637 104 aa7.3□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W SGD1Q06132 899 aa7.3□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W MET7Q08645 548 aa7.3□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W PTC5Q12511 572 aa7.3□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W FOB1O13329 566 aa7.29□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W PGK1P00560 416 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W MBR1P23493 339 aa7.29□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W MCM4P30665 933 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W ORC6P38826 435 aa7.29□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W HMF1P40037 129 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W ATG32P40458 529 aa7.29□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W VTC2P43585 828 aa7.29□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W YGR153WP48238 217 aa7.29□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W YGR273CP53329 174 aa7.29□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W SVF1Q05515 481 aa7.29□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W DUS3Q06053 668 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W ARP6Q12509 438 aa7.29□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W ILV1P00927 576 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W TKL1P23254 680 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W TFC4P33339 1025 aa7.28□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W DID4P36108 232 aa7.28□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W VPS29P38759 282 aa7.28□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W NDT80P38830 627 aa7.28□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W THI6P41835 540 aa7.28□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W NCS6P53088 359 aa7.28□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W ZPR1P53303 486 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W CBK1P53894 756 aa7.28□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W ORC4P54791 529 aa7.28□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W TFC8Q12308 588 aa7.28□□□□□ -1.24
YHK8YHR048W PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data7.27□□□□□ -1.25not detected
YHK8YHR048W RRM3P38766 723 aa7.27□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W YER130CP39959 443 aa7.27□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W FYV10P40492 516 aa7.27□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W UBA2P52488 636 aa7.27□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W SEC5P89102 971 aa7.27□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W SLD5Q03406 294 aa7.27□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W MSC6Q08818 692 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W ERP3Q12403 225 aa7.27□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W HOP09932 586 aa7.27□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W CLN3P13365 580 aa7.27□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W CLC1P17891 233 aa7.27□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W HIR1P32479 840 aa7.27□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W SAC6P32599 642 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W SHP1P34223 423 aa7.27□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W REG2P38232 338 aa7.27□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W FUS2Q05670 677 aa7.27□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W DUS4Q06063 367 aa7.27□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W GPA1P08539 472 aa7.26□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data7.26□□□□□ -1.25not detected
YHK8YHR048W NPR3P38742 1146 aa7.26□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W NUP82P40368 713 aa7.26□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W UBP15P50101 1230 aa7.26□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W MDR1P53258 950 aa7.26□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W KRE33P53914 1056 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W ICL2Q12031 575 aa7.26□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W SRD1P09007 221 aa7.25□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W CDC15P27636 974 aa7.25□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W SUV3P32580 737 aa7.25□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W TVP38P36164 337 aa7.25□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W MAP2P38174 421 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W RRD1P40454 393 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W TFG2P41896 400 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W GPD2P41911 440 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W PGA2P53903 129 aa7.25□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W HCR1Q05775 265 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W CRD1Q07560 283 aa7.25□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W PSR2Q07949 397 aa7.25□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W PET10P36139 283 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53.6 ms