RNA–Protein interactions for RNA: YGR229C

SMI1, Transcript of Protein involved in the regulation of cell wall synthesis, yeast

Gene SMI1, Length 1,518 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMI1	YGR229C	MCM10	P32354	571 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SMI1	YGR229C	ANP1	P32629	500 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SMI1	YGR229C	TFC4	P33339	1025 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SMI1	YGR229C	KTR2	P33550	425 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SMI1	YGR229C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
SMI1	YGR229C	RRN3	P36070	627 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SMI1	YGR229C	LDH1	P38139	375 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SMI1	YGR229C	QDR2	P40474	542 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SMI1	YGR229C	YGR016W	P53209	190 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SMI1	YGR229C	YNL011C	P53980	444 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SMI1	YGR229C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
SMI1	YGR229C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SMI1	YGR229C	REH1	Q06709	432 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SMI1	YGR229C	OXR1	Q08952	273 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SMI1	YGR229C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SMI1	YGR229C	HSP42	Q12329	375 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SMI1	YGR229C	BAS1	P22035	811 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	HSP78	P33416	811 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	KTR4	P38131	464 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	SAP185	P40856	1058 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	VTC2	P43585	828 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	BFA1	P47113	574 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	SKP1	P52286	194 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	MAL11	P53048	616 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	NSG2	P53898	299 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	APC11	Q12157	165 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	MED1	Q12321	566 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	NUP145	P49687	1317 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	SPS1	P08458	490 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	RPC31	P17890	251 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	FPS1	P23900	669 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.2	□□□□□ -1.74	not detected
SMI1	YGR229C	DBF20	P32328	564 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	MDJ1	P35191	511 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	BET3	P36149	193 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	YBR287W	P38355	427 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	MRPS18	P42847	217 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	YNL058C	P53947	316 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	SYT1	Q06836	1226 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	FMP25	Q08023	583 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	AI1	P03875	834 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	PTP2	P29461	750 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	MKK2	P32491	506 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	SAS3	P34218	831 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	MAM1	P40065	302 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	UFD2	P54860	961 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	CDC55	Q00362	526 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	EEB1	Q02891	456 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	ERO1	Q03103	563 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	UGO1	Q03327	502 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	VTI1	Q04338	217 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	SPO75	Q07798	868 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	CDC45	Q08032	650 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	THI72	Q08579	599 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	SSP2	Q08646	371 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	GCR1	P07261	785 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	UGA4	P32837	571 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	NUP120	P35729	1037 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	YHL041W	P38730	149 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	CAJ1	P39101	391 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	HXT8	P40886	569 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	HEH2	Q03281	663 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	TAF8	Q03750	510 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	DAL4	Q04895	635 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	YDR286C	Q05530	114 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	QCR6	P00127	147 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	MEF1	P25039	761 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	ARE1	P25628	610 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	DPH2	P32461	534 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	PTH2	P34222	208 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	GIP1	P38229	639 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	APM2	P38700	605 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SMI1	YGR229C	FIR1	P40020	876 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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