RNA–Protein interactions for RNA: YER009W

NTF2, Transcript of Nuclear envelope protein, yeastyeast

Gene NTF2, Length 378 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTF2YER009W SEA4P38164 1038 aa4.48□□□□□ -1.69
NTF2YER009W SPF1P39986 1215 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
NTF2YER009W RCM1P53972 490 aa4.48□□□□□ -1.69
NTF2YER009W YPL066WQ12194 479 aa4.48□□□□□ -1.69
NTF2YER009W YVC1Q12324 675 aa4.48□□□□□ -1.69
NTF2YER009W YER152CP10356 443 aa4.47□□□□□ -1.69
NTF2YER009W SBA1P28707 216 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
NTF2YER009W YKL107WP34251 309 aa4.47□□□□□ -1.69
NTF2YER009W YGL176CP46945 554 aa4.47□□□□□ -1.69
NTF2YER009W YGR130CP53278 816 aa4.47□□□□□ -1.69
NTF2YER009W GNT1Q12096 491 aa4.47□□□□□ -1.69
NTF2YER009W YSC84P32793 468 aa4.46□□□□□ -1.7
NTF2YER009W VBA5P36172 582 aa4.46□□□□□ -1.7
NTF2YER009W OCA5P38738 679 aa4.46□□□□□ -1.7
NTF2YER009W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
NTF2YER009W SHE9Q04172 456 aa4.46□□□□□ -1.7
NTF2YER009W TRP3P00937 484 aa4.45□□□□□ -1.7
NTF2YER009W PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data4.45□□□□□ -1.7not detected
NTF2YER009W YHL012WP38709 493 aa4.45□□□□□ -1.7
NTF2YER009W TAT2P38967 592 aa4.45□□□□□ -1.7
NTF2YER009W SNF7P39929 240 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
NTF2YER009W RPN3P40016 523 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
NTF2YER009W YJL049WP47048 450 aa4.45□□□□□ -1.7
NTF2YER009W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
NTF2YER009W NSI1Q12457 570 aa4.45□□□□□ -1.7
NTF2YER009W CYC7P00045 113 aa4.44□□□□□ -1.7
NTF2YER009W SAM35P14693 329 aa4.44□□□□□ -1.7
NTF2YER009W TNA1P53322 534 aa4.44□□□□□ -1.7
NTF2YER009W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
NTF2YER009W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
NTF2YER009W MED7Q08278 222 aa4.44□□□□□ -1.7
NTF2YER009W TRE1Q08919 783 aa4.44□□□□□ -1.7
NTF2YER009W COQ4O13525 335 aa4.43□□□□□ -1.7
NTF2YER009W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
NTF2YER009W RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
NTF2YER009W RAD4P14736 754 aa4.43□□□□□ -1.7
NTF2YER009W STE5P32917 917 aa4.43□□□□□ -1.7
NTF2YER009W MDL2P33311 773 aa4.43□□□□□ -1.7
NTF2YER009W MRP8P35719 219 aa4.43□□□□□ -1.7
NTF2YER009W PEX7P39108 375 aa4.43□□□□□ -1.7
NTF2YER009W MBP1P39678 833 aa4.43□□□□□ -1.7
NTF2YER009W SIP5P40210 489 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
NTF2YER009W NAN1Q02931 896 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
NTF2YER009W YOL098CQ12496 1037 aa4.43□□□□□ -1.7
NTF2YER009W RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
NTF2YER009W GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
NTF2YER009W SNF5P18480 905 aa4.42□□□□□ -1.7
NTF2YER009W DBP2P24783 546 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
NTF2YER009W SRO9P25567 434 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
NTF2YER009W PRO1P32264 428 aa4.42□□□□□ -1.7
NTF2YER009W YKR073CP36153 106 aa4.42□□□□□ -1.7
NTF2YER009W BAP2P38084 609 aa4.42□□□□□ -1.7
NTF2YER009W PBY1P38254 753 aa4.42□□□□□ -1.7
NTF2YER009W YBR184WP38299 523 aa4.42□□□□□ -1.7
NTF2YER009W PNT1P38969 423 aa4.42□□□□□ -1.7
NTF2YER009W MXR1P40029 184 aa4.42□□□□□ -1.7
NTF2YER009W IRR1P40541 1150 aa4.42□□□□□ -1.7
NTF2YER009W YFL054CP43549 646 aa4.42□□□□□ -1.7
NTF2YER009W CCZ1P38273 704 aa4.41□□□□□ -1.7
NTF2YER009W PTC7P38797 343 aa4.41□□□□□ -1.7
NTF2YER009W PIK1P39104 1066 aa4.41□□□□□ -1.7
NTF2YER009W IOC3P43596 787 aa4.41□□□□□ -1.7
NTF2YER009W SSY1Q03770 852 aa4.41□□□□□ -1.7
NTF2YER009W TOS1P38288 455 aa4.4□□□□□ -1.71
NTF2YER009W GEM1P39722 662 aa4.4□□□□□ -1.71
NTF2YER009W GTS1P40956 396 aa4.4□□□□□ -1.71
NTF2YER009W TIM54P47045 478 aa4.4□□□□□ -1.71
NTF2YER009W ALO1P54783 526 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
NTF2YER009W SDH1Q00711 640 aa4.4□□□□□ -1.71
NTF2YER009W UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data4.4□□□□□ -1.71not detected
NTF2YER009W NSE3Q05541 303 aa4.4□□□□□ -1.71
NTF2YER009W SPO75Q07798 868 aa4.4□□□□□ -1.71
NTF2YER009W RSC58Q07979 502 aa4.4□□□□□ -1.71
NTF2YER009W NBA1Q08229 501 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
NTF2YER009W ACM1Q08981 209 aa4.4□□□□□ -1.71
NTF2YER009W YTA7P40340 1379 aa4.4□□□□□ -1.71
NTF2YER009W STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data4.39□□□□□ -1.71not detected
NTF2YER009W ADP1P25371 1049 aa4.39□□□□□ -1.71
NTF2YER009W RPL8BP29453 256 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
NTF2YER009W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
NTF2YER009W UGA2P38067 497 aa4.39□□□□□ -1.71
NTF2YER009W PFD1P46988 109 aa4.39□□□□□ -1.71
NTF2YER009W BDF2Q07442 638 aa4.39□□□□□ -1.71
NTF2YER009W FMP25Q08023 583 aa4.39□□□□□ -1.71
NTF2YER009W RSB1Q08417 382 aa4.39□□□□□ -1.71
NTF2YER009W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
NTF2YER009W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data4.38□□□□□ -1.71not detected
NTF2YER009W AIM26P32858 118 aa4.38□□□□□ -1.71
NTF2YER009W SLA2P33338 968 aa4.38□□□□□ -1.71
NTF2YER009W HUL5P53119 910 aa4.38□□□□□ -1.71
NTF2YER009W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
NTF2YER009W OSH2Q12451 1283 aa4.38□□□□□ -1.71
NTF2YER009W THS1P04801 734 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
NTF2YER009W PRP9P19736 530 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
NTF2YER009W OMA1P36163 345 aa4.37□□□□□ -1.71
NTF2YER009W ERP6P53198 216 aa4.37□□□□□ -1.71
NTF2YER009W BRE4Q07660 1125 aa4.37□□□□□ -1.71
NTF2YER009W BI4P03879 638 aa4.36□□□□□ -1.71
NTF2YER009W SPS1P08458 490 aa4.36□□□□□ -1.71
NTF2YER009W HSP60P19882 572 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
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