RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W BIO2P32451 375 aa5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W SSO1P32867 290 aa5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W BUD2P33314 1104 aa5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W RSM22P36056 628 aa5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W PSY4P38193 441 aa5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W APS3P47064 194 aa5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W MON1P53129 644 aa5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W RAD33Q04231 177 aa5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W MDM36Q06820 579 aa5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W NOP12Q08208 459 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W ACF2Q12168 779 aa5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W LTE1P07866 1435 aa5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W CIT2P08679 460 aa5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W KRR1P25586 316 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W RPC19P28000 142 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W YKL222CP35995 705 aa5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W SMC2P38989 1170 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W CWC15Q03772 175 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W SXM1Q04175 944 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W CDC60P26637 1090 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W YBL028CP38202 106 aa5.53□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W SNZ3P43545 298 aa5.53□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W UBA2P52488 636 aa5.53□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W SNZ2P53824 298 aa5.53□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W IPI3P53877 555 aa5.53□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W SWA2Q06677 668 aa5.53□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W CDC25P04821 1589 aa5.53□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W IQG1Q12280 1495 aa5.53□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W RAV1P47104 1357 aa5.53□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W TUP1P16649 713 aa5.53□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W OXP1P28273 1286 aa5.53□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W YSW1P38280 609 aa5.53□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W IPL1P38991 367 aa5.53□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W MNT3P40549 630 aa5.53□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W STB1P42845 420 aa5.53□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W UBP15P50101 1230 aa5.53□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W PEX14P53112 341 aa5.53□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W MCP2Q06567 569 aa5.53□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W ROM2P51862 1356 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YML002WP0CF17 737 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W RSR1P13856 272 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W KRS1P15180 591 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W KGD2P19262 463 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W PMA2P19657 947 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YAP1P19880 650 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W SPE2P21182 396 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W CLB4P24871 460 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W POL4P25615 582 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W SEC21P32074 935 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TFC4P33339 1025 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W DUR3P33413 735 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W SET3P36124 751 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W IFA38P38286 347 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W GLO3P38682 493 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W VPS29P38759 282 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YEL023CP39992 682 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W GCN20P43535 752 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W SHE10P53075 577 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YGL082WP53155 381 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W HST1P53685 503 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YNL144CP53907 740 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W FDC1Q03034 503 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W RTT10Q08924 1013 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W MED4Q12343 284 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TRX2P22803 104 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W VAN1P23642 535 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W KIP2P28743 706 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W SSE1P32589 693 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W CCL1P37366 393 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YCK3P39962 524 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W MDV1P47025 714 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W ZDS2P54786 942 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W MTC5Q03897 1148 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YKU80Q04437 629 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W DCS1Q06151 350 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W RKR1Q04781 1562 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TY1B-BRQ12193 1756 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TY1B-GR3Q12316 1755 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TY1B-ORQ92393 1755 aa5.52□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W THS1P04801 734 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W PBS2P08018 668 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W HOM3P10869 527 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W DIT1P21623 536 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W AAD3P25612 363 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W XRS2P33301 854 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W MAK5P38112 773 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W BIM1P40013 344 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YFL066CP43538 392 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W RBL2P48606 106 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W NUP84P52891 726 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W GCR2Q01722 534 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TIM50Q02776 476 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W FAR8Q05040 523 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.8 ms