RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	RIT1	P23796	513 aa		5.38	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	YHL050C	P38721	697 aa		5.38	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	SEC9	P40357	651 aa		5.38	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	EFM4	P40516	257 aa		5.38	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	YFH7	P43591	353 aa		5.38	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	BOP3	P53958	396 aa		5.38	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	HDA1	P53973	706 aa		5.38	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	TLG2	Q08144	397 aa		5.38	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	YPL260W	Q08977	551 aa		5.38	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	PLP2	Q12017	286 aa		5.38	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	HKR1	P41809	1802 aa		5.37	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	CIT1	P00890	479 aa		5.37	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	CKI1	P20485	582 aa		5.37	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	MDL2	P33311	773 aa		5.37	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	SAS3	P34218	831 aa		5.37	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	SPL2	P38839	148 aa		5.37	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	VFA1	P40080	203 aa		5.37	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	ATG3	P40344	310 aa		5.37	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	CSM2	P40465	213 aa		5.37	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	THI6	P41835	540 aa		5.37	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	RET3	P53600	189 aa		5.37	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	VTC3	Q02725	835 aa		5.37	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	IRC4	Q03036	179 aa		5.37	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	OMS1	Q06668	471 aa		5.37	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	OPY2	Q06810	360 aa		5.37	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	PSR2	Q07949	397 aa		5.37	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	TOP1	P04786	769 aa		5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	SNF3	P10870	884 aa		5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	CKA2	P19454	339 aa		5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	KRE2	P27809	442 aa		5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	SEC20	P28791	383 aa		5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	VPS8	P39702	1274 aa		5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	LYS14	P40971	790 aa		5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	HUL4	P40985	892 aa		5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	JJJ2	P46997	583 aa		5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	YGR153W	P48238	217 aa		5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	SAS4	Q04003	481 aa		5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	YAP7	Q08182	245 aa		5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	NUR1	Q12066	484 aa		5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	YOL087C	Q99247	1116 aa		5.36	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	MYO1	P08964	1928 aa		5.35	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	CDC8	P00572	216 aa		5.35	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	OM45	P16547	393 aa		5.35	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	SIT4	P20604	311 aa		5.35	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	RAM1	P22007	431 aa		5.35	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	UBP1	P25037	809 aa		5.35	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	NPR2	P39923	615 aa		5.35	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	VID27	P40157	782 aa		5.35	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	MAD1	P40957	749 aa		5.35	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	PXA1	P41909	870 aa		5.35	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	HFM1	P51979	1187 aa		5.35	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	UBA2	P52488	636 aa		5.35	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	YGL140C	P53120	1219 aa		5.35	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	IRC3	Q06683	689 aa		5.35	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	ISU2	Q12056	156 aa		5.35	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	YPR015C	Q12531	247 aa		5.35	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	FLO1	P32768	1537 aa		5.35	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	SPO12	P17123	173 aa		5.34	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	AMS1	P22855	1083 aa		5.34	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	RAD57	P25301	460 aa		5.34	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	CLB5	P30283	435 aa		5.34	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	PSO2	P30620	661 aa		5.34	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	HXT1	P32465	570 aa		5.34	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	UGA2	P38067	497 aa		5.34	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	TDA3	P38758	523 aa		5.34	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	APL6	P46682	809 aa		5.34	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	ENV11	P53246	860 aa		5.34	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	LSC2	P53312	427 aa		5.34	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	NGL3	Q03210	505 aa		5.34	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	TRS120	Q04183	1289 aa		5.34	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	GIS4	Q04233	774 aa		5.34	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	GYL1	Q04322	720 aa		5.34	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	CSM3	Q04659	317 aa		5.34	□□□□□ -1.55

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