RNA–Protein interactions for RNA: YBL009W

ALK2, Transcript of Protein kinase, yeast

Gene ALK2, Length 2,031 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ALK2	YBL009W	VMR1	P38735	1592 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	ASF1	P32447	279 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	YKL077W	P36081	392 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	HXT13	P39924	564 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	XKS1	P42826	600 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	HXT17	P53631	564 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	HXT15	P54854	567 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	EAR1	Q03212	550 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	HDA2	Q06629	674 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	YLR122C	Q12312	125 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	DNF3	Q12674	1656 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	GCR1	P07261	785 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	SQT1	P35184	431 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	MRPS18	P42847	217 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	TRP3	P00937	484 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	AFG2	P32794	780 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	DUT1	P33317	147 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	SAF1	P38352	637 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	MCD1	Q12158	566 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	SEA4	P38164	1038 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	SHU2	P38957	223 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	ROD1	Q02805	837 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	GIC2	Q06648	383 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	PEP7	P32609	515 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	YKR073C	P36153	106 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	YNR063W	P53749	607 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	IML1	P47170	1584 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	YAP3	P38749	330 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	ALT1	P52893	592 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	PDR11	P40550	1411 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.09	□□□□□ -1.91	not detected
ALK2	YBL009W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	COQ2	P32378	372 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	YAR028W	P39548	234 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	EST2	Q06163	884 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ALK2	YBL009W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	NFS1	P25374	497 aa		3.09	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	ADD66	P36040	267 aa		3.09	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	YGR130C	P53278	816 aa		3.09	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	EEB1	Q02891	456 aa		3.09	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	RMD1	Q03441	430 aa		3.09	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	MRL1	Q06815	381 aa		3.09	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	AVO1	Q08236	1176 aa		3.09	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	YLL054C	Q12244	843 aa		3.09	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	HAP1	P0CE41	1502 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	KAE1	P36132	386 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	SIW14	P53965	281 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	CHS2	P14180	963 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	MKK2	P32491	506 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	CTH1	P47976	325 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	RER2	P35196	286 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	MMM1	P41800	426 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	INP52	P50942	1183 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	RKM2	Q03942	479 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	TAF13	P11747	167 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	CDC34	P14682	295 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	PET112	P33893	541 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	ALG3	P38179	458 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	SDH1	Q00711	640 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	VPS16	Q03308	798 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	RTT10	Q08924	1013 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	YVC1	Q12324	675 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	USO1	P25386	1790 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	CYC7	P00045	113 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	NNK1	P36003	928 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	GPB2	P39717	880 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	YFL054C	P43549	646 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	YJL045W	P47052	634 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	TPP1	Q03796	238 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
ALK2	YBL009W	RAV1	P47104	1357 aa		3.05	□□□□□ -1.92

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