RNA–Protein interactions for RNA: YBL008W-A

YBL008W-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YBL008W-A, Length 240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL008W-AYBL008W-A ICT1Q12385 394 aa3.44□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A SNF5P18480 905 aa3.43□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A KIP1P28742 1111 aa3.43□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A IRC10Q08118 586 aa3.43□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A INP54Q08227 384 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A MSH3P25336 1018 aa3.42□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A GPB2P39717 880 aa3.42□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A PFK1P16861 987 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A MCH5Q08777 521 aa3.41□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A KIN2P13186 1147 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A RKM2Q03942 479 aa3.4□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A VMA4P22203 233 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A PEX2P32800 271 aa3.39□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A CDC55Q00362 526 aa3.39□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A MNL2Q12205 849 aa3.39□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data3.38□□□□□ -1.87not detected
YBL008W-AYBL008W-A MDM10P18409 493 aa3.38□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A APL1P27351 700 aa3.38□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A GLO3P38682 493 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A STB4P50104 949 aa3.38□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A EXG2P52911 562 aa3.38□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A PEX13P80667 386 aa3.38□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A SIZ1Q04195 904 aa3.38□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A HOF1Q05080 669 aa3.38□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A YOL073CQ08232 322 aa3.37□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A TMT1P32643 299 aa3.36□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A ADD66P36040 267 aa3.36□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A QDR1P40475 563 aa3.36□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data3.36□□□□□ -1.87not detected
YBL008W-AYBL008W-A RPN3P40016 523 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A YLR040CQ07988 224 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A SVS1Q12254 260 aa3.35□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A MTH1P35198 433 aa3.34□□□□□ -1.87
YBL008W-AYBL008W-A AFG2P32794 780 aa3.33□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A SUL1P38359 859 aa3.33□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A YFL054CP43549 646 aa3.33□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A TRS120Q04183 1289 aa3.33□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A OMS1Q06668 471 aa3.33□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A EFT1P32324 842 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A TPO1Q07824 586 aa3.32□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A PTC5Q12511 572 aa3.32□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A RDH54P38086 958 aa3.31□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A MET12P46151 657 aa3.31□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A MSC2Q03455 724 aa3.31□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A YCS4Q06156 1176 aa3.31□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A ACF2Q12168 779 aa3.31□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A HIS5P07172 385 aa3.3□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A GND2P53319 492 aa3.3□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A TIM44Q01852 431 aa3.3□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A YMR206WQ03695 313 aa3.3□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A PEP7P32609 515 aa3.29□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A SPC42P36094 363 aa3.29□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A MND2P40577 368 aa3.29□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A RSM26P47141 266 aa3.29□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A ADY3Q07732 790 aa3.29□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A LAS17Q12446 633 aa3.29□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A KCS1Q12494 1050 aa3.29□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A CHA4P43634 648 aa3.28□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A BUL1P48524 976 aa3.28□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A SEC5P89102 971 aa3.28□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A YPL260WQ08977 551 aa3.28□□□□□ -1.88
YBL008W-AYBL008W-A ALG3P38179 458 aa3.27□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A POA1P38218 177 aa3.27□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A PEX28P38848 579 aa3.27□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A DAK2P43550 591 aa3.27□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A COQ11Q05892 277 aa3.27□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A EST2Q06163 884 aa3.27□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A HEM13P11353 328 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A ACF4P47129 309 aa3.26□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A GLO1P50107 326 aa3.26□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A MUK1Q02866 612 aa3.26□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A ENB1Q08299 606 aa3.26□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A SSA4P22202 642 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A SQT1P35184 431 aa3.25□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A KTR4P38131 464 aa3.25□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A SCS3P53012 380 aa3.25□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A IMO32P53219 342 aa3.25□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A ATG13Q06628 738 aa3.25□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A BNR1P40450 1375 aa3.25□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A UGA4P32837 571 aa3.24□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A KAR5Q04746 504 aa3.24□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A YNL162W-AQ3E7A8 72 aa3.24□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A ATG1P53104 897 aa3.23□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A YGL140CP53120 1219 aa3.23□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data3.23□□□□□ -1.89not detected
YBL008W-AYBL008W-A ERG4P25340 473 aa3.22□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A LEO1P38439 464 aa3.22□□□□□ -1.89
YBL008W-AYBL008W-A SAM37P50110 327 aa3.21□□□□□ -1.9
YBL008W-AYBL008W-A ULP1Q02724 621 aa3.21□□□□□ -1.9
YBL008W-AYBL008W-A SUT2Q12286 268 aa3.21□□□□□ -1.9
YBL008W-AYBL008W-A PRP40P33203 583 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
YBL008W-AYBL008W-A PPZ2P33329 710 aa3.2□□□□□ -1.9
YBL008W-AYBL008W-A ZRG8P40021 1076 aa3.2□□□□□ -1.9
YBL008W-AYBL008W-A GPI13Q07830 1017 aa3.2□□□□□ -1.9
YBL008W-AYBL008W-A RPP2AP05319 106 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
YBL008W-AYBL008W-A DED1P06634 604 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
YBL008W-AYBL008W-A ACE2P21192 770 aa3.19□□□□□ -1.9
YBL008W-AYBL008W-A RIX1P38883 763 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
YBL008W-AYBL008W-A NPC2Q12408 173 aa3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.7 ms