RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613500.4

NLRP1-215, Transcript of NLR family pyrin domain containing 1, human

TSL 5 BASIC

Gene NLRP1, Length 4,494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NLRP1-215	ENST00000613500	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	NBPF4	Q96M43	638 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	BICD2	Q8TD16	824 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	MARCH6	O60337	910 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	GNAI3	P08754	354 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	GRM1	Q13255	1194 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	NFE2L2	Q16236	605 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	11.92	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	SYCE3	A1L190	88 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	SETDB2	Q96T68	719 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	ST5	P78524	1137 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	USP8	P40818	1118 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NLRP1-215	ENST00000613500	GNPAT	O15228	680 aa		11.9	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	TRPM2	O94759	1503 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	HSPA1L	P34931	641 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	PTPRK	Q15262	1439 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	KIF20A	O95235	890 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	CENPH	Q9H3R5	247 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	OFD1	O75665	1012 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	NPAT	Q14207	1427 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	ABCA8	O94911	1581 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	REC8	O95072	547 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	SLC39A6	Q13433	755 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		11.87	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		11.87	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	IP6K1	Q92551	441 aa		11.87	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	TRIM37	O94972	964 aa		11.87	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		11.87	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		11.87	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	RUFY1	Q96T51	708 aa		11.87	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500		H3BQV1	296 aa		11.87	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	IFFO2	Q5TF58	517 aa		11.87	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		11.87	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		11.87	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	FIBP	O43427	364 aa		11.86	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	TRDN	Q13061	729 aa		11.86	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	FAM182B	Q5T319	152 aa		11.86	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	SIL1	Q9H173	461 aa		11.86	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		11.86	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		11.86	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	CERS3	Q8IU89	383 aa		11.86	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	JDP2	Q8WYK2	163 aa		11.86	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	SIRT1	Q96EB6	747 aa		11.86	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	AFF2	P51816	1311 aa		11.86	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	CDR1	P51861	262 aa		11.86	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		11.86	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		11.85	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		11.85	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		11.85	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		11.85	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	MTMR7	Q9Y216	660 aa		11.85	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		11.85	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	WWC1	Q8IX03	1113 aa		11.85	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
NLRP1-215	ENST00000613500	NLRP1	Q9C000	1473 aa		11.85	□□□□□ -0.51

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