RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597816.5

LTBP4-218, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene LTBP4, Length 692 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-218ENST00000597816 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.55■■□□□ 1.04
LTBP4-218ENST00000597816 FCHSD2O94868 740 aa21.54■■□□□ 1.04
LTBP4-218ENST00000597816 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.54■■□□□ 1.04
LTBP4-218ENST00000597816 PRKAR2BP31323 418 aa21.53■■□□□ 1.04
LTBP4-218ENST00000597816 PTGER2P43116 358 aa21.53■■□□□ 1.04
LTBP4-218ENST00000597816 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.53■■□□□ 1.04
LTBP4-218ENST00000597816 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
LTBP4-218ENST00000597816 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.53■■□□□ 1.04
LTBP4-218ENST00000597816 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.52■■□□□ 1.04
LTBP4-218ENST00000597816 AK7Q96M32 723 aa21.52■■□□□ 1.04
LTBP4-218ENST00000597816 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.52■■□□□ 1.04
LTBP4-218ENST00000597816 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.52■■□□□ 1.03
LTBP4-218ENST00000597816 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.51■■□□□ 1.03
LTBP4-218ENST00000597816 MSH5O43196 834 aa21.51■■□□□ 1.03
LTBP4-218ENST00000597816 ITPK1Q13572 414 aa21.51■■□□□ 1.03
LTBP4-218ENST00000597816 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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LTBP4-218ENST00000597816 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.5■■□□□ 1.03
LTBP4-218ENST00000597816 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.49■■□□□ 1.03
LTBP4-218ENST00000597816 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.49■■□□□ 1.03
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LTBP4-218ENST00000597816 MAP3K5Q99683 1374 aa21.47■■□□□ 1.03
LTBP4-218ENST00000597816 C4BP0C0L5 1744 aa21.46■■□□□ 1.03
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LTBP4-218ENST00000597816 POLD1P28340 1107 aa21.45■■□□□ 1.02
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LTBP4-218ENST00000597816 TEFQ10587 303 aa21.44■■□□□ 1.02
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LTBP4-218ENST00000597816 SLC39A6Q13433 755 aa21.43■■□□□ 1.02
LTBP4-218ENST00000597816 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.43■■□□□ 1.02
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LTBP4-218ENST00000597816 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.42■■□□□ 1.02
LTBP4-218ENST00000597816 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.42■■□□□ 1.02
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LTBP4-218ENST00000597816 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
LTBP4-218ENST00000597816 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
LTBP4-218ENST00000597816 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.4■■□□□ 1.02
LTBP4-218ENST00000597816 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
LTBP4-218ENST00000597816 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.4■■□□□ 1.02
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LTBP4-218ENST00000597816 SYT17Q9BSW7 474 aa21.39■■□□□ 1.01
LTBP4-218ENST00000597816 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
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LTBP4-218ENST00000597816 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.37■■□□□ 1.01
LTBP4-218ENST00000597816 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.36■■□□□ 1.01
LTBP4-218ENST00000597816 ZNF790Q6PG37 636 aa21.36■■□□□ 1.01
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LTBP4-218ENST00000597816 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
LTBP4-218ENST00000597816 NFE2L2Q16236 605 aa21.34■■□□□ 1.01
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LTBP4-218ENST00000597816 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
LTBP4-218ENST00000597816 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.33■■□□□ 1.01
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LTBP4-218ENST00000597816 RFC4P35249 363 aa21.33■■□□□ 1.01
LTBP4-218ENST00000597816 DCTN1Q14203 1278 aa21.33■■□□□ 1.01
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LTBP4-218ENST00000597816 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.32■■□□□ 1
LTBP4-218ENST00000597816 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.32■■□□□ 1
LTBP4-218ENST00000597816 STARD3NLO95772 234 aa21.31■■□□□ 1
LTBP4-218ENST00000597816 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
LTBP4-218ENST00000597816 KLHL34Q8N239 644 aa21.31■■□□□ 1
LTBP4-218ENST00000597816 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.31■■□□□ 1
LTBP4-218ENST00000597816 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
LTBP4-218ENST00000597816 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.3■■□□□ 1
LTBP4-218ENST00000597816 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
LTBP4-218ENST00000597816 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
LTBP4-218ENST00000597816 TJP1Q07157 1748 aa21.29■■□□□ 1
LTBP4-218ENST00000597816 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.29■■□□□ 1
LTBP4-218ENST00000597816 KCNQ3O43525 872 aa21.29■■□□□ 1
LTBP4-218ENST00000597816 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.28■■□□□ 1
LTBP4-218ENST00000597816 GYS1P13807 737 aa21.27■■□□□ 1
LTBP4-218ENST00000597816 RIPK4P57078 832 aa21.26■□□□□ 0.99
LTBP4-218ENST00000597816 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.26■□□□□ 0.99
LTBP4-218ENST00000597816 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.26■□□□□ 0.99
LTBP4-218ENST00000597816 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
LTBP4-218ENST00000597816 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.25■□□□□ 0.99
LTBP4-218ENST00000597816 MMP10P09238 476 aa21.25■□□□□ 0.99
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