RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 PPP2R1AP30153 589 aa21.58■■□□□ 1.05
EFTUD2-215ENST00000589825 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.57■■□□□ 1.04
EFTUD2-215ENST00000589825 ARXQ96QS3 562 aa21.57■■□□□ 1.04
EFTUD2-215ENST00000589825 C4BP0C0L5 1744 aa21.57■■□□□ 1.04
EFTUD2-215ENST00000589825 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
EFTUD2-215ENST00000589825 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
EFTUD2-215ENST00000589825 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
EFTUD2-215ENST00000589825 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.54■■□□□ 1.04
EFTUD2-215ENST00000589825 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.54■■□□□ 1.04
EFTUD2-215ENST00000589825 PHF14O94880 888 aa21.53■■□□□ 1.04
EFTUD2-215ENST00000589825 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.53■■□□□ 1.04
EFTUD2-215ENST00000589825 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.53■■□□□ 1.04
EFTUD2-215ENST00000589825 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
EFTUD2-215ENST00000589825 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
EFTUD2-215ENST00000589825 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
EFTUD2-215ENST00000589825 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
EFTUD2-215ENST00000589825 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
EFTUD2-215ENST00000589825 ITPK1Q13572 414 aa21.52■■□□□ 1.04
EFTUD2-215ENST00000589825 KLHL34Q8N239 644 aa21.52■■□□□ 1.04
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.52■■□□□ 1.04
EFTUD2-215ENST00000589825 GNPATO15228 680 aa21.51■■□□□ 1.03
EFTUD2-215ENST00000589825 SSFA2P28290 1259 aa21.51■■□□□ 1.03
EFTUD2-215ENST00000589825 SYT17Q9BSW7 474 aa21.51■■□□□ 1.03
EFTUD2-215ENST00000589825 LGR6Q9HBX8 967 aa21.51■■□□□ 1.03
EFTUD2-215ENST00000589825 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
EFTUD2-215ENST00000589825 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.49■■□□□ 1.03
EFTUD2-215ENST00000589825 PRKAR2BP31323 418 aa21.49■■□□□ 1.03
EFTUD2-215ENST00000589825 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
EFTUD2-215ENST00000589825 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
EFTUD2-215ENST00000589825 MSL1Q68DK7 614 aa21.49■■□□□ 1.03
EFTUD2-215ENST00000589825 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
EFTUD2-215ENST00000589825 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.48■■□□□ 1.03
EFTUD2-215ENST00000589825 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.47■■□□□ 1.03
EFTUD2-215ENST00000589825 NEFMP07197 916 aa21.47■■□□□ 1.03
EFTUD2-215ENST00000589825 MAP3K5Q99683 1374 aa21.47■■□□□ 1.03
EFTUD2-215ENST00000589825 FCHSD2O94868 740 aa21.46■■□□□ 1.03
EFTUD2-215ENST00000589825 TEFQ10587 303 aa21.46■■□□□ 1.03
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.46■■□□□ 1.03
EFTUD2-215ENST00000589825 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.46■■□□□ 1.03
EFTUD2-215ENST00000589825 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.45■■□□□ 1.02
EFTUD2-215ENST00000589825 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
EFTUD2-215ENST00000589825 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.45■■□□□ 1.02
EFTUD2-215ENST00000589825 RALBP1Q15311 655 aa21.44■■□□□ 1.02
EFTUD2-215ENST00000589825 SMIM5Q71RC9 77 aa21.44■■□□□ 1.02
EFTUD2-215ENST00000589825 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.44■■□□□ 1.02
EFTUD2-215ENST00000589825 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.44■■□□□ 1.02
EFTUD2-215ENST00000589825 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.43■■□□□ 1.02
EFTUD2-215ENST00000589825 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
EFTUD2-215ENST00000589825 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.43■■□□□ 1.02
EFTUD2-215ENST00000589825 MRC1P22897 1456 aa21.43■■□□□ 1.02
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC39A6Q13433 755 aa21.42■■□□□ 1.02
EFTUD2-215ENST00000589825 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
EFTUD2-215ENST00000589825 RPS6KA4O75676 772 aa21.41■■□□□ 1.02
EFTUD2-215ENST00000589825 ADRA2BP18089 450 aa21.41■■□□□ 1.02
EFTUD2-215ENST00000589825 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.4■■□□□ 1.02
EFTUD2-215ENST00000589825 RFC4P35249 363 aa21.4■■□□□ 1.02
EFTUD2-215ENST00000589825 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
EFTUD2-215ENST00000589825 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
EFTUD2-215ENST00000589825 IL17REQ8NFR9 667 aa21.39■■□□□ 1.01
EFTUD2-215ENST00000589825 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
EFTUD2-215ENST00000589825 GPR162Q16538 588 aa21.37■■□□□ 1.01
EFTUD2-215ENST00000589825 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.37■■□□□ 1.01
EFTUD2-215ENST00000589825 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
EFTUD2-215ENST00000589825 TJP1Q07157 1748 aa21.36■■□□□ 1.01
EFTUD2-215ENST00000589825 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.36■■□□□ 1.01
EFTUD2-215ENST00000589825 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.36■■□□□ 1.01
EFTUD2-215ENST00000589825 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
EFTUD2-215ENST00000589825 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.35■■□□□ 1.01
EFTUD2-215ENST00000589825 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.34■■□□□ 1.01
EFTUD2-215ENST00000589825 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
EFTUD2-215ENST00000589825 BTBD11A6QL63 1104 aa21.34■■□□□ 1.01
EFTUD2-215ENST00000589825 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF790Q6PG37 636 aa21.34■■□□□ 1.01
EFTUD2-215ENST00000589825 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.34■■□□□ 1.01
EFTUD2-215ENST00000589825 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
EFTUD2-215ENST00000589825 STARD3NLO95772 234 aa21.33■■□□□ 1.01
EFTUD2-215ENST00000589825 YY1P25490 414 aa21.33■■□□□ 1.01
EFTUD2-215ENST00000589825 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.33■■□□□ 1.01
EFTUD2-215ENST00000589825 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.33■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.33■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 MMP10P09238 476 aa21.32■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 MCM10Q7L590 875 aa21.32■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.32■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 ZPR1O75312 459 aa21.31■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.31■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 GYS1P13807 737 aa21.3■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.29■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.29■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 C4AP0C0L4 1744 aa21.29■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 DCTN1Q14203 1278 aa21.28■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.27■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms