RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572560.1

AKAP1-209, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene AKAP1, Length 442 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP1-209ENST00000572560 FCHSD2O94868 740 aa21.89■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 RFC4P35249 363 aa21.89■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 ITPK1Q13572 414 aa21.89■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.89■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.88■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 PHKG2P15735 406 aa21.88■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 ATG3Q9NT62 314 aa21.88■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa21.87■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 EYA1Q99502 592 aa21.87■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 ITGB4P16144 1822 aa21.87■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.85■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.85■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.84■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 DPEP1P16444 411 aa21.84■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.84■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 PIM2Q9P1W9 311 aa21.84■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 RPS6KA4O75676 772 aa21.83■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 FSTL1Q12841 308 aa21.83■■□□□ 1.09
AKAP1-209ENST00000572560 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
AKAP1-209ENST00000572560 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.83■■□□□ 1.08
AKAP1-209ENST00000572560 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.83■■□□□ 1.08
AKAP1-209ENST00000572560 NCAPD2Q15021 1401 aa21.82■■□□□ 1.08
AKAP1-209ENST00000572560 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.82■■□□□ 1.08
AKAP1-209ENST00000572560 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.82■■□□□ 1.08
AKAP1-209ENST00000572560 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.82■■□□□ 1.08
AKAP1-209ENST00000572560 DCAF5Q96JK2 942 aa21.81■■□□□ 1.08
AKAP1-209ENST00000572560 GYS1P13807 737 aa21.8■■□□□ 1.08
AKAP1-209ENST00000572560 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
AKAP1-209ENST00000572560 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.8■■□□□ 1.08
AKAP1-209ENST00000572560 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.8■■□□□ 1.08
AKAP1-209ENST00000572560 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
AKAP1-209ENST00000572560 CABP4P57796 275 aa21.79■■□□□ 1.08
AKAP1-209ENST00000572560 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
AKAP1-209ENST00000572560 KLRG1Q96E93 195 aa21.79■■□□□ 1.08
AKAP1-209ENST00000572560 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.78■■□□□ 1.08
AKAP1-209ENST00000572560 POLKQ9UBT6 870 aa21.78■■□□□ 1.08
AKAP1-209ENST00000572560 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.76■■□□□ 1.07
AKAP1-209ENST00000572560 RNF181Q9P0P0 153 aa21.76■■□□□ 1.07
AKAP1-209ENST00000572560 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
AKAP1-209ENST00000572560 KDRP35968 1356 aa21.74■■□□□ 1.07
AKAP1-209ENST00000572560 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.74■■□□□ 1.07
AKAP1-209ENST00000572560 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.74■■□□□ 1.07
AKAP1-209ENST00000572560 JMYQ8N9B5 988 aa21.74■■□□□ 1.07
AKAP1-209ENST00000572560 KCNA3P22001 575 aa21.73■■□□□ 1.07
AKAP1-209ENST00000572560 MTHFSP49914 203 aa21.73■■□□□ 1.07
AKAP1-209ENST00000572560 SMC1BQ8NDV3 1235 aa21.73■■□□□ 1.07
AKAP1-209ENST00000572560 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.73■■□□□ 1.07
AKAP1-209ENST00000572560 RRAGCQ9HB90 399 aa21.73■■□□□ 1.07
AKAP1-209ENST00000572560 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
AKAP1-209ENST00000572560 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
AKAP1-209ENST00000572560 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
AKAP1-209ENST00000572560 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
AKAP1-209ENST00000572560 ZPR1O75312 459 aa21.7■■□□□ 1.06
AKAP1-209ENST00000572560 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
AKAP1-209ENST00000572560 C4AP0C0L4 1744 aa21.69■■□□□ 1.06
AKAP1-209ENST00000572560 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
AKAP1-209ENST00000572560 TNS4Q8IZW8 715 aa21.69■■□□□ 1.06
AKAP1-209ENST00000572560 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
AKAP1-209ENST00000572560 HTRA3P83110 453 aa21.68■■□□□ 1.06
AKAP1-209ENST00000572560 FKBP8Q14318 412 aa21.68■■□□□ 1.06
AKAP1-209ENST00000572560 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
AKAP1-209ENST00000572560 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.67■■□□□ 1.06
AKAP1-209ENST00000572560 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.67■■□□□ 1.06
AKAP1-209ENST00000572560 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.67■■□□□ 1.06
AKAP1-209ENST00000572560 WDR90Q96KV7 1748 aa21.66■■□□□ 1.06
AKAP1-209ENST00000572560 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.66■■□□□ 1.06
AKAP1-209ENST00000572560 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
AKAP1-209ENST00000572560 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
AKAP1-209ENST00000572560 CAPN15O75808 1086 aa21.65■■□□□ 1.06
AKAP1-209ENST00000572560 CHRNA5P30532 468 aa21.65■■□□□ 1.06
AKAP1-209ENST00000572560 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.64■■□□□ 1.06
AKAP1-209ENST00000572560 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.63■■□□□ 1.05
AKAP1-209ENST00000572560 LMNB1P20700 586 aa21.63■■□□□ 1.05
AKAP1-209ENST00000572560 DDR1Q08345 913 aa21.63■■□□□ 1.05
AKAP1-209ENST00000572560 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
AKAP1-209ENST00000572560 TM4SF1P30408 202 aa21.62■■□□□ 1.05
AKAP1-209ENST00000572560 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.62■■□□□ 1.05
AKAP1-209ENST00000572560 GLTPD2A6NH11 291 aa21.61■■□□□ 1.05
AKAP1-209ENST00000572560 PRELPP51888 382 aa21.61■■□□□ 1.05
AKAP1-209ENST00000572560 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.61■■□□□ 1.05
AKAP1-209ENST00000572560 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
AKAP1-209ENST00000572560 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
AKAP1-209ENST00000572560 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.59■■□□□ 1.05
AKAP1-209ENST00000572560 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
AKAP1-209ENST00000572560 TTLL6Q8N841 843 aa21.59■■□□□ 1.05
AKAP1-209ENST00000572560 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.58■■□□□ 1.05
AKAP1-209ENST00000572560 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
AKAP1-209ENST00000572560 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.57■■□□□ 1.04
AKAP1-209ENST00000572560 H0YIN7 160 aa21.56■■□□□ 1.04
AKAP1-209ENST00000572560 MORC1Q86VD1 984 aa21.56■■□□□ 1.04
AKAP1-209ENST00000572560 NARFQ9UHQ1 456 aa21.56■■□□□ 1.04
AKAP1-209ENST00000572560 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
AKAP1-209ENST00000572560 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
AKAP1-209ENST00000572560 RASSF7Q02833 373 aa21.55■■□□□ 1.04
AKAP1-209ENST00000572560 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.1 ms