RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572172.5

GPS2-208, Transcript of G protein pathway suppressor 2, human

TSL 5

Gene GPS2, Length 1,534 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS2-208	ENST00000572172	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		32.6	■■■□□ 2.81
GPS2-208	ENST00000572172	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		32.59	■■■□□ 2.81
GPS2-208	ENST00000572172	BTBD11	A6QL63	1104 aa		32.59	■■■□□ 2.81
GPS2-208	ENST00000572172	MBIP	Q9NS73	344 aa		32.59	■■■□□ 2.81
GPS2-208	ENST00000572172	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GPS2-208	ENST00000572172	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
GPS2-208	ENST00000572172	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GPS2-208	ENST00000572172	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		32.57	■■■□□ 2.8
GPS2-208	ENST00000572172	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.56	■■■□□ 2.8
GPS2-208	ENST00000572172	MRC1	P22897	1456 aa		32.54	■■■□□ 2.8
GPS2-208	ENST00000572172	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
GPS2-208	ENST00000572172	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.8
GPS2-208	ENST00000572172	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.8
GPS2-208	ENST00000572172	BCL9	O00512	1426 aa		32.51	■■■□□ 2.79
GPS2-208	ENST00000572172	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
GPS2-208	ENST00000572172	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		32.49	■■■□□ 2.79
GPS2-208	ENST00000572172	PIGB	Q92521	554 aa		32.49	■■■□□ 2.79
GPS2-208	ENST00000572172	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		32.49	■■■□□ 2.79
GPS2-208	ENST00000572172	FAM182B	Q5T319	152 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GPS2-208	ENST00000572172	ZNF790	Q6PG37	636 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GPS2-208	ENST00000572172	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		32.46	■■■□□ 2.79
GPS2-208	ENST00000572172	RGS12	O14924	1447 aa		32.46	■■■□□ 2.79
GPS2-208	ENST00000572172	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
GPS2-208	ENST00000572172	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
GPS2-208	ENST00000572172	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GPS2-208	ENST00000572172	SLC39A6	Q13433	755 aa		32.45	■■■□□ 2.78
GPS2-208	ENST00000572172	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GPS2-208	ENST00000572172	KCNQ3	O43525	872 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GPS2-208	ENST00000572172	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
GPS2-208	ENST00000572172	KCNQ2	O43526	872 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GPS2-208	ENST00000572172	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GPS2-208	ENST00000572172	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GPS2-208	ENST00000572172	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
GPS2-208	ENST00000572172	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GPS2-208	ENST00000572172	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
GPS2-208	ENST00000572172	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GPS2-208	ENST00000572172	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GPS2-208	ENST00000572172	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GPS2-208	ENST00000572172	ITGB4	P16144	1822 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GPS2-208	ENST00000572172	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
GPS2-208	ENST00000572172	TSPYL6	Q8N831	410 aa		32.37	■■■□□ 2.77
GPS2-208	ENST00000572172	ZNF428	Q96B54	188 aa		32.37	■■■□□ 2.77
GPS2-208	ENST00000572172	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.37	■■■□□ 2.77
GPS2-208	ENST00000572172	VAMP4	O75379	141 aa		32.36	■■■□□ 2.77
GPS2-208	ENST00000572172	KRT24	Q2M2I5	525 aa		32.36	■■■□□ 2.77
GPS2-208	ENST00000572172	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
GPS2-208	ENST00000572172	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
GPS2-208	ENST00000572172	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		32.36	■■■□□ 2.77
GPS2-208	ENST00000572172	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
GPS2-208	ENST00000572172	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		32.36	■■■□□ 2.77
GPS2-208	ENST00000572172	HOXB7	P09629	217 aa		32.35	■■■□□ 2.77
GPS2-208	ENST00000572172	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		32.34	■■■□□ 2.77
GPS2-208	ENST00000572172	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
GPS2-208	ENST00000572172	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
GPS2-208	ENST00000572172	SOCS7	O14512	581 aa		32.32	■■■□□ 2.76
GPS2-208	ENST00000572172	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
GPS2-208	ENST00000572172	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		32.29	■■■□□ 2.76
GPS2-208	ENST00000572172	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		32.29	■■■□□ 2.76
GPS2-208	ENST00000572172	TRIM37	O94972	964 aa		32.28	■■■□□ 2.76
GPS2-208	ENST00000572172	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
GPS2-208	ENST00000572172	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
GPS2-208	ENST00000572172	NHS	Q6T4R5	1651 aa		32.28	■■■□□ 2.76
GPS2-208	ENST00000572172	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.27	■■■□□ 2.76
GPS2-208	ENST00000572172	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		32.26	■■■□□ 2.76
GPS2-208	ENST00000572172	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		32.26	■■■□□ 2.75
GPS2-208	ENST00000572172	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
GPS2-208	ENST00000572172	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		32.25	■■■□□ 2.75
GPS2-208	ENST00000572172	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.25	■■■□□ 2.75
GPS2-208	ENST00000572172	SBF2	Q86WG5	1849 aa		32.25	■■■□□ 2.75
GPS2-208	ENST00000572172	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		32.24	■■■□□ 2.75
GPS2-208	ENST00000572172	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
GPS2-208	ENST00000572172	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		32.22	■■■□□ 2.75
GPS2-208	ENST00000572172	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		32.22	■■■□□ 2.75
GPS2-208	ENST00000572172	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.21	■■■□□ 2.75
GPS2-208	ENST00000572172	SIK1	P57059	783 aa		32.21	■■■□□ 2.75
GPS2-208	ENST00000572172	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		32.21	■■■□□ 2.75
GPS2-208	ENST00000572172	STK31	Q9BXU1	1019 aa		32.21	■■■□□ 2.75
GPS2-208	ENST00000572172	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		32.21	■■■□□ 2.75
GPS2-208	ENST00000572172	USP16	Q9Y5T5	823 aa		32.2	■■■□□ 2.74
GPS2-208	ENST00000572172	BCAR3	O75815	825 aa		32.18	■■■□□ 2.74
GPS2-208	ENST00000572172	NECTIN2	Q92692	538 aa		32.18	■■■□□ 2.74
GPS2-208	ENST00000572172	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
GPS2-208	ENST00000572172	BTAF1	O14981	1849 aa		32.18	■■■□□ 2.74
GPS2-208	ENST00000572172	STARD3NL	O95772	234 aa		32.17	■■■□□ 2.74
GPS2-208	ENST00000572172	ATP6V1A	P38606	617 aa		32.17	■■■□□ 2.74
GPS2-208	ENST00000572172	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		32.17	■■■□□ 2.74
GPS2-208	ENST00000572172	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		32.17	■■■□□ 2.74
GPS2-208	ENST00000572172	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
GPS2-208	ENST00000572172	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
GPS2-208	ENST00000572172	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		32.16	■■■□□ 2.74
GPS2-208	ENST00000572172	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
GPS2-208	ENST00000572172	SLC4A2	P04920	1241 aa		32.15	■■■□□ 2.74
GPS2-208	ENST00000572172	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
GPS2-208	ENST00000572172	APBA3	O96018	575 aa		32.13	■■■□□ 2.73
GPS2-208	ENST00000572172	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
GPS2-208	ENST00000572172	ERBB4	Q15303	1308 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GPS2-208	ENST00000572172	PLSCR1	O15162	318 aa		32.11	■■■□□ 2.73
GPS2-208	ENST00000572172	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		32.11	■■■□□ 2.73
GPS2-208	ENST00000572172	KIF16B	Q96L93	1317 aa		32.11	■■■□□ 2.73
GPS2-208	ENST00000572172	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	32.1	■■■□□ 2.73

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