RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 IGSF1Q8N6C5 1336 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-218ENST00000550159 FCHSD2O94868 740 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-218ENST00000550159 AMOTQ4VCS5 1084 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-218ENST00000550159 SULT6B1Q6IMI4 303 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-218ENST00000550159 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-218ENST00000550159 FAM9BQ8IZU0 186 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-218ENST00000550159 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
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CS-218ENST00000550159 SPG7Q9UQ90 795 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-218ENST00000550159 COL18A1P39060 1754 aa12.7□□□□□ -0.38
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CS-218ENST00000550159 IL13P35225 146 aa12.69□□□□□ -0.38
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CS-218ENST00000550159 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
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CS-218ENST00000550159 EYA1Q99502 592 aa12.67□□□□□ -0.38
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CS-218ENST00000550159 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
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CS-218ENST00000550159 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
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CS-218ENST00000550159 NBPF4Q96M43 638 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-218ENST00000550159 PRKAR2BP31323 418 aa12.64□□□□□ -0.39
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CS-218ENST00000550159 USHBP1Q8N6Y0 703 aa12.64□□□□□ -0.39
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CS-218ENST00000550159 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP12.64□□□□□ -0.392e-6■■□□□ 11.9
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CS-218ENST00000550159 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
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CS-218ENST00000550159 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-218ENST00000550159 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-218ENST00000550159 RGPD5Q99666 1765 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-218ENST00000550159 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-218ENST00000550159 IFNL2Q8IZJ0 200 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-218ENST00000550159 KDRP35968 1356 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-218ENST00000550159 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
CS-218ENST00000550159 RSPH6AQ9H0K4 717 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-218ENST00000550159 BCS1LQ9Y276 419 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-218ENST00000550159 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CS-218ENST00000550159 GNAT3A8MTJ3 354 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-218ENST00000550159 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CS-218ENST00000550159 AKAP4Q5JQC9 854 aa12.59□□□□□ -0.39
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CS-218ENST00000550159 AEBP1Q8IUX7 1158 aa12.58□□□□□ -0.4
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CS-218ENST00000550159 RRAGCQ9HB90 399 aa12.58□□□□□ -0.4
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CS-218ENST00000550159 RIPK4P57078 832 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-218ENST00000550159 TEFQ10587 303 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-218ENST00000550159 NEUROD2Q15784 382 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-218ENST00000550159 NFE2L2Q16236 605 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-218ENST00000550159 C9orf131Q5VYM1 1079 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-218ENST00000550159 SMC1BQ8NDV3 1235 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-218ENST00000550159 KDM2BQ8NHM5 1336 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-218ENST00000550159 SMIM5Q71RC9 77 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-218ENST00000550159 AK7Q96M32 723 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-218ENST00000550159 A0A0G2JLW4 131 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-218ENST00000550159 APAF1O14727 1248 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-218ENST00000550159 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP12.55□□□□□ -0.4
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CS-218ENST00000550159 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-218ENST00000550159 DCAF5Q96JK2 942 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-218ENST00000550159 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-218ENST00000550159 NCAPD2Q15021 1401 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-218ENST00000550159 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-218ENST00000550159 TMPOP42166 694 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-218ENST00000550159 FAM161AQ3B820 660 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-218ENST00000550159 AMIGO3Q86WK7 504 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-218ENST00000550159 CHMP4AQ9BY43 222 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-218ENST00000550159 LY75O60449 1722 aa12.54□□□□□ -0.4
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CS-218ENST00000550159 TGFB2P61812 414 aa12.53□□□□□ -0.4
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CS-218ENST00000550159 PHKG2P15735 406 aa12.52□□□□□ -0.41
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CS-218ENST00000550159 TTC5Q8N0Z6 440 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-218ENST00000550159 PHACTR3Q96KR7 559 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-218ENST00000550159 TMOD3Q9NYL9 352 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-218ENST00000550159 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-218ENST00000550159 PXDNLA1KZ92 1463 aa12.51□□□□□ -0.41
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