RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 RGS12O14924 1447 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 DOT1LQ8TEK3 1739 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 BRWD3Q6RI45 1802 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 CHL1O00533 1208 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 KCNQ3O43525 872 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 CFAP44Q96MT7 982 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 IFT57Q9NWB7 429 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 KRT24Q2M2I5 525 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 SLC52A2Q9HAB3 445 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 KDM3BQ7LBC6 1761 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 RXRBP28702 533 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 GNAI1P63096 354 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 TEFQ10587 303 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 TSPYL4Q9UJ04 414 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 ITGB4P16144 1822 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 PAPPAQ13219 1627 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 ERVV-2B6SEH9 535 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 CABP4P57796 275 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 SLC39A6Q13433 755 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 PTF1AQ7RTS3 328 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 TSPYL6Q8N831 410 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 ACSBG1Q96GR2 724 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 MYH16Q9H6N6 1097 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 BCL9O00512 1426 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 BTBD11A6QL63 1104 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 KCNQ2O43526 872 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 C8orf58Q8NAV2 365 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 PIGBQ92521 554 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 KRT27Q7Z3Y8 459 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 BABAM1Q9NWV8 329 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 KCPQ6ZWJ8 1503 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 UBR2Q8IWV8 1755 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 NHSQ6T4R5 1651 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 SBF2Q86WG5 1849 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 ZNF790Q6PG37 636 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 TMOD3Q9NYL9 352 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 ASAP1Q9ULH1 1129 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 HEG1Q9ULI3 1381 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 ATG3Q9NT62 314 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 C5P01031 1676 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 KAT6BQ8WYB5 2073 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 VAMP4O75379 141 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 BTAF1O14981 1849 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 SLC4A9Q96Q91 983 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 RCAN3Q9UKA8 241 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 RARSP54136 660 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 FAM196AQ6ZSG2 479 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 BCL2L13Q9BXK5 485 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-216ENST00000549221 BCAR3O75815 825 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 TTC5Q8N0Z6 440 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 SSH1Q8WYL5 1049 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 NECTIN2Q92692 538 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 PALLDQ8WX93 1383 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 TJP1Q07157 1748 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 TRIM37O94972 964 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 FMNL2Q96PY5 1086 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 USP16Q9Y5T5 823 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 LAMB4A4D0S4 1761 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 HOXB7P09629 217 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 DNAJC10Q8IXB1 793 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 RNF123Q5XPI4 1314 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 ANXA1P04083 346 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 KCNQ4P56696 695 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 ITPK1Q13572 414 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 PROSER3Q2NL68 480 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 TNNQ9UQP3 1299 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 CEP350Q5VT06 3117 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 LY75O60449 1722 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 PLIN1O60240 522 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 SIK1P57059 783 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 PDIA6Q15084 440 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 G2E3Q7L622 706 aa10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms