RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527871.5

RPS2-208, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 1 (best)

Gene RPS2, Length 1,243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-208	ENST00000527871	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
RPS2-208	ENST00000527871	DCAF5	Q96JK2	942 aa		33.3	■■■□□ 2.92
RPS2-208	ENST00000527871	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		33.29	■■■□□ 2.92
RPS2-208	ENST00000527871	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	33.29	■■■□□ 2.92	not detected	■■■□□ 14.7
RPS2-208	ENST00000527871	SSFA2	P28290	1259 aa		33.29	■■■□□ 2.92
RPS2-208	ENST00000527871	PHF14	O94880	888 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RPS2-208	ENST00000527871	IL13	P35225	146 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RPS2-208	ENST00000527871	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RPS2-208	ENST00000527871	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		33.27	■■■□□ 2.92
RPS2-208	ENST00000527871	KDR	P35968	1356 aa		33.26	■■■□□ 2.92
RPS2-208	ENST00000527871	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
RPS2-208	ENST00000527871	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
RPS2-208	ENST00000527871	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
RPS2-208	ENST00000527871	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
RPS2-208	ENST00000527871	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		33.23	■■■□□ 2.91
RPS2-208	ENST00000527871	GNPAT	O15228	680 aa		33.22	■■■□□ 2.91
RPS2-208	ENST00000527871	GRIN3B	O60391	1043 aa		33.19	■■■□□ 2.9
RPS2-208	ENST00000527871	MTHFS	P49914	203 aa		33.19	■■■□□ 2.9
RPS2-208	ENST00000527871	CABP4	P57796	275 aa		33.18	■■■□□ 2.9
RPS2-208	ENST00000527871	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
RPS2-208	ENST00000527871	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		33.15	■■■□□ 2.9
RPS2-208	ENST00000527871	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		33.15	■■■□□ 2.9
RPS2-208	ENST00000527871	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RPS2-208	ENST00000527871	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		33.12	■■■□□ 2.89
RPS2-208	ENST00000527871	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
RPS2-208	ENST00000527871	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		33.1	■■■□□ 2.89
RPS2-208	ENST00000527871	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
RPS2-208	ENST00000527871	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
RPS2-208	ENST00000527871	RPS6KA4	O75676	772 aa		33.09	■■■□□ 2.89
RPS2-208	ENST00000527871	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
RPS2-208	ENST00000527871	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
RPS2-208	ENST00000527871	MMP10	P09238	476 aa		33.07	■■■□□ 2.88
RPS2-208	ENST00000527871	ADRA2B	P18089	450 aa		33.07	■■■□□ 2.88
RPS2-208	ENST00000527871	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		33.07	■■■□□ 2.88
RPS2-208	ENST00000527871	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
RPS2-208	ENST00000527871	LGR6	Q9HBX8	967 aa		33.06	■■■□□ 2.88
RPS2-208	ENST00000527871	HMOX1	P09601	288 aa		33.04	■■■□□ 2.88
RPS2-208	ENST00000527871	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		33.04	■■■□□ 2.88
RPS2-208	ENST00000527871	GYS1	P13807	737 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RPS2-208	ENST00000527871	C1QTNF8	P60827	252 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RPS2-208	ENST00000527871	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		33.02	■■■□□ 2.88
RPS2-208	ENST00000527871	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		33.02	■■■□□ 2.88
RPS2-208	ENST00000527871	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		33.01	■■■□□ 2.87
RPS2-208	ENST00000527871	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
RPS2-208	ENST00000527871	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
RPS2-208	ENST00000527871	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
RPS2-208	ENST00000527871	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
RPS2-208	ENST00000527871	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		32.99	■■■□□ 2.87
RPS2-208	ENST00000527871	RFC4	P35249	363 aa		32.98	■■■□□ 2.87
RPS2-208	ENST00000527871	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
RPS2-208	ENST00000527871	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		32.94	■■■□□ 2.86
RPS2-208	ENST00000527871	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
RPS2-208	ENST00000527871	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		32.94	■■■□□ 2.86
RPS2-208	ENST00000527871	TGFB2	P61812	414 aa		32.94	■■■□□ 2.86
RPS2-208	ENST00000527871	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
RPS2-208	ENST00000527871	TJP1	Q07157	1748 aa		32.94	■■■□□ 2.86
RPS2-208	ENST00000527871	ADCY9	O60503	1353 aa		32.93	■■■□□ 2.86
RPS2-208	ENST00000527871	MRC1	P22897	1456 aa		32.93	■■■□□ 2.86
RPS2-208	ENST00000527871	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		32.92	■■■□□ 2.86
RPS2-208	ENST00000527871	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
RPS2-208	ENST00000527871	SLC39A6	Q13433	755 aa		32.92	■■■□□ 2.86
RPS2-208	ENST00000527871	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		32.92	■■■□□ 2.86
RPS2-208	ENST00000527871	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
RPS2-208	ENST00000527871	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		32.92	■■■□□ 2.86
RPS2-208	ENST00000527871	ATP10D	Q9P241	1426 aa		32.92	■■■□□ 2.86
RPS2-208	ENST00000527871	C4A	P0C0L4	1744 aa		32.91	■■■□□ 2.86
RPS2-208	ENST00000527871	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		32.9	■■■□□ 2.86
RPS2-208	ENST00000527871	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
RPS2-208	ENST00000527871		A0A0G2JLW4	131 aa		32.89	■■■□□ 2.86
RPS2-208	ENST00000527871	FKBP8	Q14318	412 aa		32.89	■■■□□ 2.86
RPS2-208	ENST00000527871	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
RPS2-208	ENST00000527871	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		32.87	■■■□□ 2.85
RPS2-208	ENST00000527871	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		32.87	■■■□□ 2.85
RPS2-208	ENST00000527871	KCNA3	P22001	575 aa		32.86	■■■□□ 2.85
RPS2-208	ENST00000527871	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
RPS2-208	ENST00000527871	DPEP1	P16444	411 aa		32.85	■■■□□ 2.85
RPS2-208	ENST00000527871	DDR1	Q08345	913 aa		32.85	■■■□□ 2.85
RPS2-208	ENST00000527871	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		32.85	■■■□□ 2.85
RPS2-208	ENST00000527871	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
RPS2-208	ENST00000527871	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
RPS2-208	ENST00000527871	TM4SF1	P30408	202 aa		32.83	■■■□□ 2.85
RPS2-208	ENST00000527871	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		32.83	■■■□□ 2.85
RPS2-208	ENST00000527871	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
RPS2-208	ENST00000527871	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		32.82	■■■□□ 2.84
RPS2-208	ENST00000527871	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
RPS2-208	ENST00000527871	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		32.81	■■■□□ 2.84
RPS2-208	ENST00000527871	CEP350	Q5VT06	3117 aa		32.81	■■■□□ 2.84
RPS2-208	ENST00000527871	BCS1L	Q9Y276	419 aa		32.8	■■■□□ 2.84
RPS2-208	ENST00000527871	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
RPS2-208	ENST00000527871	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		32.78	■■■□□ 2.84
RPS2-208	ENST00000527871	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
RPS2-208	ENST00000527871	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		32.77	■■■□□ 2.84
RPS2-208	ENST00000527871	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		32.76	■■■□□ 2.83
RPS2-208	ENST00000527871	NARF	Q9UHQ1	456 aa		32.76	■■■□□ 2.83
RPS2-208	ENST00000527871	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		32.75	■■■□□ 2.83
RPS2-208	ENST00000527871	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		32.75	■■■□□ 2.83
RPS2-208	ENST00000527871	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		32.75	■■■□□ 2.83
RPS2-208	ENST00000527871	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83

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