RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518564.1

PPP2CB-204, Transcript of protein phosphatase 2 catalytic subunit beta, human

TSL 3 BASIC

Gene PPP2CB, Length 691 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP2CB-204	ENST00000518564	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		42.34	■■■■■ 4.37
PPP2CB-204	ENST00000518564	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37
PPP2CB-204	ENST00000518564	POLD1	P28340	1107 aa		42.33	■■■■■ 4.37
PPP2CB-204	ENST00000518564	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		42.33	■■■■■ 4.37
PPP2CB-204	ENST00000518564	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		42.33	■■■■■ 4.37
PPP2CB-204	ENST00000518564	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	42.32	■■■■■ 4.37
PPP2CB-204	ENST00000518564	ARX	Q96QS3	562 aa		42.32	■■■■■ 4.37
PPP2CB-204	ENST00000518564	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		42.32	■■■■■ 4.36
PPP2CB-204	ENST00000518564	NUDC	Q9Y266	331 aa		42.31	■■■■■ 4.36
PPP2CB-204	ENST00000518564	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	42.3	■■■■■ 4.36
PPP2CB-204	ENST00000518564	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		42.3	■■■■■ 4.36
PPP2CB-204	ENST00000518564	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	42.3	■■■■■ 4.36
PPP2CB-204	ENST00000518564	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		42.29	■■■■■ 4.36
PPP2CB-204	ENST00000518564	ITPK1	Q13572	414 aa		42.28	■■■■■ 4.36
PPP2CB-204	ENST00000518564	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	42.27	■■■■■ 4.36
PPP2CB-204	ENST00000518564	MRC1	P22897	1456 aa		42.26	■■■■■ 4.36
PPP2CB-204	ENST00000518564	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		42.24	■■■■■ 4.35
PPP2CB-204	ENST00000518564	PHF14	O94880	888 aa		42.24	■■■■■ 4.35
PPP2CB-204	ENST00000518564	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		42.24	■■■■■ 4.35
PPP2CB-204	ENST00000518564	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		42.23	■■■■■ 4.35
PPP2CB-204	ENST00000518564	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	42.23	■■■■■ 4.35
PPP2CB-204	ENST00000518564	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	42.22	■■■■■ 4.35
PPP2CB-204	ENST00000518564	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		42.22	■■■■■ 4.35
PPP2CB-204	ENST00000518564	GNPAT	O15228	680 aa		42.21	■■■■■ 4.35
PPP2CB-204	ENST00000518564	SSFA2	P28290	1259 aa		42.21	■■■■■ 4.35
PPP2CB-204	ENST00000518564	LGR6	Q9HBX8	967 aa		42.21	■■■■■ 4.35
PPP2CB-204	ENST00000518564	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	42.2	■■■■■ 4.35
PPP2CB-204	ENST00000518564	SYT17	Q9BSW7	474 aa		42.19	■■■■■ 4.34
PPP2CB-204	ENST00000518564	MAP3K5	Q99683	1374 aa		42.18	■■■■■ 4.34
PPP2CB-204	ENST00000518564	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	42.18	■■■■■ 4.34
PPP2CB-204	ENST00000518564	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	42.18	■■■■■ 4.34
PPP2CB-204	ENST00000518564	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	42.18	■■■■■ 4.34
PPP2CB-204	ENST00000518564	MSL1	Q68DK7	614 aa		42.18	■■■■■ 4.34
PPP2CB-204	ENST00000518564	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		42.18	■■■■■ 4.34
PPP2CB-204	ENST00000518564	PRKAR2B	P31323	418 aa		42.17	■■■■■ 4.34
PPP2CB-204	ENST00000518564	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		42.17	■■■■■ 4.34
PPP2CB-204	ENST00000518564	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		42.17	■■■■■ 4.34
PPP2CB-204	ENST00000518564	KLHL34	Q8N239	644 aa		42.16	■■■■■ 4.34
PPP2CB-204	ENST00000518564	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	42.14	■■■■■ 4.34
PPP2CB-204	ENST00000518564	TJP1	Q07157	1748 aa		42.12	■■■■■ 4.33
PPP2CB-204	ENST00000518564	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		42.12	■■■■■ 4.33
PPP2CB-204	ENST00000518564	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		42.12	■■■■■ 4.33
PPP2CB-204	ENST00000518564	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	42.11	■■■■■ 4.33
PPP2CB-204	ENST00000518564	SMIM5	Q71RC9	77 aa		42.11	■■■■■ 4.33
PPP2CB-204	ENST00000518564	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	42.1	■■■■■ 4.33
PPP2CB-204	ENST00000518564	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	42.09	■■■■■ 4.33
PPP2CB-204	ENST00000518564	FCHSD2	O94868	740 aa		42.07	■■■■■ 4.33
PPP2CB-204	ENST00000518564	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		42.07	■■■■■ 4.33
PPP2CB-204	ENST00000518564	TEF	Q10587	303 aa		42.05	■■■■■ 4.32
PPP2CB-204	ENST00000518564	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	42.04	■■■■■ 4.32
PPP2CB-204	ENST00000518564	SLC39A6	Q13433	755 aa		42.04	■■■■■ 4.32
PPP2CB-204	ENST00000518564	RALBP1	Q15311	655 aa		42.04	■■■■■ 4.32
PPP2CB-204	ENST00000518564	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		42.03	■■■■■ 4.32
PPP2CB-204	ENST00000518564	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	42.03	■■■■■ 4.32
PPP2CB-204	ENST00000518564	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		42.02	■■■■■ 4.32
PPP2CB-204	ENST00000518564	ADRA2B	P18089	450 aa		42.02	■■■■■ 4.32
PPP2CB-204	ENST00000518564	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		42.02	■■■■■ 4.32
PPP2CB-204	ENST00000518564	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	42.01	■■■■■ 4.32
PPP2CB-204	ENST00000518564	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	42	■■■■■ 4.31
PPP2CB-204	ENST00000518564	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		42	■■■■■ 4.31
PPP2CB-204	ENST00000518564	RPS6KA4	O75676	772 aa		41.99	■■■■■ 4.31
PPP2CB-204	ENST00000518564	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		41.99	■■■■■ 4.31
PPP2CB-204	ENST00000518564	NEFM	P07197	916 aa		41.98	■■■■■ 4.31
PPP2CB-204	ENST00000518564	C4A	P0C0L4	1744 aa		41.98	■■■■■ 4.31
PPP2CB-204	ENST00000518564	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		41.96	■■■■■ 4.31
PPP2CB-204	ENST00000518564	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		41.95	■■■■■ 4.31
PPP2CB-204	ENST00000518564	RFC4	P35249	363 aa		41.94	■■■■■ 4.3
PPP2CB-204	ENST00000518564	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	41.94	■■■■■ 4.3
PPP2CB-204	ENST00000518564	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	41.93	■■■■■ 4.3
PPP2CB-204	ENST00000518564	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		41.91	■■■■■ 4.3
PPP2CB-204	ENST00000518564	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		41.9	■■■■■ 4.3
PPP2CB-204	ENST00000518564	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		41.89	■■■■■ 4.3
PPP2CB-204	ENST00000518564	ZNF790	Q6PG37	636 aa		41.88	■■■■■ 4.29
PPP2CB-204	ENST00000518564	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		41.88	■■■■■ 4.29
PPP2CB-204	ENST00000518564	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	41.88	■■■■■ 4.29
PPP2CB-204	ENST00000518564	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	41.86	■■■■■ 4.29
PPP2CB-204	ENST00000518564	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		41.86	■■■■■ 4.29
PPP2CB-204	ENST00000518564	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	41.86	■■■■■ 4.29
PPP2CB-204	ENST00000518564	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	41.85	■■■■■ 4.29
PPP2CB-204	ENST00000518564	GPR162	Q16538	588 aa		41.85	■■■■■ 4.29
PPP2CB-204	ENST00000518564	MMP10	P09238	476 aa		41.84	■■■■■ 4.29
PPP2CB-204	ENST00000518564	MCM10	Q7L590	875 aa		41.84	■■■■■ 4.29
PPP2CB-204	ENST00000518564	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	41.84	■■■■■ 4.29
PPP2CB-204	ENST00000518564	BTBD11	A6QL63	1104 aa		41.83	■■■■■ 4.29
PPP2CB-204	ENST00000518564	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	41.83	■■■■■ 4.29
PPP2CB-204	ENST00000518564	YY1	P25490	414 aa		41.82	■■■■■ 4.29
PPP2CB-204	ENST00000518564	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		41.82	■■■■■ 4.29
PPP2CB-204	ENST00000518564	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	41.82	■■■■■ 4.29
PPP2CB-204	ENST00000518564	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		41.82	■■■■■ 4.29
PPP2CB-204	ENST00000518564	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		41.82	■■■■■ 4.29
PPP2CB-204	ENST00000518564	GYS1	P13807	737 aa		41.81	■■■■■ 4.28
PPP2CB-204	ENST00000518564	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		41.8	■■■■■ 4.28
PPP2CB-204	ENST00000518564	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	41.79	■■■■■ 4.28
PPP2CB-204	ENST00000518564	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	41.79	■■■■■ 4.28
PPP2CB-204	ENST00000518564	STARD3NL	O95772	234 aa		41.79	■■■■■ 4.28
PPP2CB-204	ENST00000518564	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		41.77	■■■■■ 4.28
PPP2CB-204	ENST00000518564	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		41.77	■■■■■ 4.28
PPP2CB-204	ENST00000518564	UTRN	P46939	3433 aa		41.77	■■■■■ 4.28
PPP2CB-204	ENST00000518564	COL15A1	P39059	1388 aa		41.76	■■■■■ 4.28
PPP2CB-204	ENST00000518564	DCTN1	Q14203	1278 aa		41.76	■■■■■ 4.28

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