RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514669.5

CTBP1-216, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTBP1, Length 809 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-216ENST00000514669 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.64■■□□□ 1.21
CTBP1-216ENST00000514669 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CTBP1-216ENST00000514669 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CTBP1-216ENST00000514669 EP400Q96L91 3159 aa22.63■■□□□ 1.21
CTBP1-216ENST00000514669 APAF1O14727 1248 aa22.62■■□□□ 1.21
CTBP1-216ENST00000514669 TEFQ10587 303 aa22.62■■□□□ 1.21
CTBP1-216ENST00000514669 MCM10Q7L590 875 aa22.62■■□□□ 1.21
CTBP1-216ENST00000514669 DCTN1Q14203 1278 aa22.61■■□□□ 1.21
CTBP1-216ENST00000514669 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.61■■□□□ 1.21
CTBP1-216ENST00000514669 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CTBP1-216ENST00000514669 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.61■■□□□ 1.21
CTBP1-216ENST00000514669 PALLDQ8WX93 1383 aa22.61■■□□□ 1.21
CTBP1-216ENST00000514669 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.6■■□□□ 1.21
CTBP1-216ENST00000514669 NEUROD2Q15784 382 aa22.6■■□□□ 1.21
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CTBP1-216ENST00000514669 ATG3Q9NT62 314 aa22.57■■□□□ 1.2
CTBP1-216ENST00000514669 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.57■■□□□ 1.2
CTBP1-216ENST00000514669 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.57■■□□□ 1.2
CTBP1-216ENST00000514669 TXNRD1Q16881 649 aa22.56■■□□□ 1.2
CTBP1-216ENST00000514669 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.56■■□□□ 1.2
CTBP1-216ENST00000514669 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.55■■□□□ 1.2
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CTBP1-216ENST00000514669 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.54■■□□□ 1.2
CTBP1-216ENST00000514669 C5P01031 1676 aa22.53■■□□□ 1.2
CTBP1-216ENST00000514669 PROM2Q8N271 834 aa22.53■■□□□ 1.2
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CTBP1-216ENST00000514669 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.52■■□□□ 1.2
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CTBP1-216ENST00000514669 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CTBP1-216ENST00000514669 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CTBP1-216ENST00000514669 SLC39A6Q13433 755 aa22.51■■□□□ 1.19
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CTBP1-216ENST00000514669 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.51■■□□□ 1.19
CTBP1-216ENST00000514669 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.5■■□□□ 1.19
CTBP1-216ENST00000514669 SIK1P57059 783 aa22.5■■□□□ 1.19
CTBP1-216ENST00000514669 NGEFQ8N5V2 710 aa22.5■■□□□ 1.19
CTBP1-216ENST00000514669 TJP1Q07157 1748 aa22.49■■□□□ 1.19
CTBP1-216ENST00000514669 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.49■■□□□ 1.19
CTBP1-216ENST00000514669 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CTBP1-216ENST00000514669 ZNF790Q6PG37 636 aa22.49■■□□□ 1.19
CTBP1-216ENST00000514669 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
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CTBP1-216ENST00000514669 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CTBP1-216ENST00000514669 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.48■■□□□ 1.19
CTBP1-216ENST00000514669 ATP6V1AP38606 617 aa22.46■■□□□ 1.19
CTBP1-216ENST00000514669 WWC1Q8IX03 1113 aa22.46■■□□□ 1.19
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CTBP1-216ENST00000514669 C4BP0C0L5 1744 aa22.45■■□□□ 1.19
CTBP1-216ENST00000514669 KCNQ4P56696 695 aa22.45■■□□□ 1.18
CTBP1-216ENST00000514669 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
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CTBP1-216ENST00000514669 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.44■■□□□ 1.18
CTBP1-216ENST00000514669 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.44■■□□□ 1.18
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CTBP1-216ENST00000514669 ITPK1Q13572 414 aa22.43■■□□□ 1.18
CTBP1-216ENST00000514669 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.43■■□□□ 1.18
CTBP1-216ENST00000514669 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CTBP1-216ENST00000514669 IFT57Q9NWB7 429 aa22.42■■□□□ 1.18
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CTBP1-216ENST00000514669 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.42■■□□□ 1.18
CTBP1-216ENST00000514669 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.41■■□□□ 1.18
CTBP1-216ENST00000514669 CHL1O00533 1208 aa22.41■■□□□ 1.18
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CTBP1-216ENST00000514669 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CTBP1-216ENST00000514669 STK32BQ9NY57 414 aa22.41■■□□□ 1.18
CTBP1-216ENST00000514669 IL16Q14005 1332 aa22.4■■□□□ 1.18
CTBP1-216ENST00000514669 GNAI1P63096 354 aa22.4■■□□□ 1.18
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CTBP1-216ENST00000514669 ZNF853P0CG23 659 aa22.39■■□□□ 1.17
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CTBP1-216ENST00000514669 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.39■■□□□ 1.17
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CTBP1-216ENST00000514669 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
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CTBP1-216ENST00000514669 MBIPQ9NS73 344 aa22.36■■□□□ 1.17
CTBP1-216ENST00000514669 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CTBP1-216ENST00000514669 STARD3NLO95772 234 aa22.33■■□□□ 1.17
CTBP1-216ENST00000514669 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CTBP1-216ENST00000514669 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CTBP1-216ENST00000514669 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CTBP1-216ENST00000514669 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.32■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 CASZ1Q86V15 1759 aa22.32■■□□□ 1.16
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