RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 GNPATO15228 680 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-220ENST00000511663 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-220ENST00000511663 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-220ENST00000511663 CABP4P57796 275 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-220ENST00000511663 MTHFSP49914 203 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-220ENST00000511663 ITPK1Q13572 414 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-220ENST00000511663 SMIM5Q71RC9 77 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-220ENST00000511663 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-220ENST00000511663 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-220ENST00000511663 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-220ENST00000511663 TRAPPC3LQ5T215 181 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-220ENST00000511663 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-220ENST00000511663 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-220ENST00000511663 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-220ENST00000511663 IL13P35225 146 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-220ENST00000511663 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-220ENST00000511663 C1QTNF8P60827 252 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-220ENST00000511663 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-220ENST00000511663 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-220ENST00000511663 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-220ENST00000511663 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-220ENST00000511663 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-220ENST00000511663 ADRA2BP18089 450 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-220ENST00000511663 RFC4P35249 363 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-220ENST00000511663 MMP10P09238 476 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-220ENST00000511663 KDRP35968 1356 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-220ENST00000511663 RPS6KA4O75676 772 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-220ENST00000511663 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-220ENST00000511663 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-220ENST00000511663 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.1■■□□□ 1.77
SH3BP2-220ENST00000511663 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
SH3BP2-220ENST00000511663 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP2-220ENST00000511663 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP2-220ENST00000511663 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SH3BP2-220ENST00000511663 HMOX1P09601 288 aa26.06■■□□□ 1.76
SH3BP2-220ENST00000511663 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.06■■□□□ 1.76
SH3BP2-220ENST00000511663 UTRNP46939 3433 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2-220ENST00000511663 TGFB2P61812 414 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2-220ENST00000511663 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SH3BP2-220ENST00000511663 GYS1P13807 737 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-220ENST00000511663 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-220ENST00000511663 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-220ENST00000511663 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-220ENST00000511663 LGR6Q9HBX8 967 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP2-220ENST00000511663 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP10DQ9P241 1426 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A0G2JLW4 131 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-220ENST00000511663 BCS1LQ9Y276 419 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-220ENST00000511663 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-220ENST00000511663 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-220ENST00000511663 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-220ENST00000511663 ZPR1O75312 459 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-220ENST00000511663 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-220ENST00000511663 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC39A6Q13433 755 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 DPEP1P16444 411 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 FCHSD2O94868 740 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 FKBP8Q14318 412 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 CFAP53Q96M91 514 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 C4AP0C0L4 1744 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 PIM2Q9P1W9 311 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 ADCY9O60503 1353 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-220ENST00000511663 TEFQ10587 303 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-220ENST00000511663 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-220ENST00000511663 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-220ENST00000511663 STARD3NLO95772 234 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-220ENST00000511663 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-220ENST00000511663 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-220ENST00000511663 TJP1Q07157 1748 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-220ENST00000511663 NARFQ9UHQ1 456 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-220ENST00000511663 NUDCQ9Y266 331 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-220ENST00000511663 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-220ENST00000511663 MRC1P22897 1456 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-220ENST00000511663 TM4SF1P30408 202 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-220ENST00000511663 DDR1Q08345 913 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-220ENST00000511663 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-220ENST00000511663 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-220ENST00000511663 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
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