RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 AKAP4Q5JQC9 854 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 KCNQ3O43525 872 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 BABAM1Q9NWV8 329 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 RGPD1P0DJD0 1748 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 CABLES1Q8TDN4 633 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa13.65□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 RGS12O14924 1447 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 TTC22Q5TAA0 569 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 CHPF2Q9P2E5 772 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 AXIN2Q9Y2T1 843 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 RNMTO43148 476 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM94Q12767 1356 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 PI4KAP2A4QPH2 592 aa13.62□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 CHRNA2Q15822 529 aa13.62□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa13.62□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.62□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 LRRCC1Q9C099 1032 aa13.62□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa13.62□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 TATP17735 454 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 CADPS2Q86UW7 1296 aa13.61□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 ATP10DQ9P241 1426 aa13.61□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 SDSP20132 328 aa13.61□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 ADAMTSL3P82987 1691 aa13.61□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa13.61□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 SURF6O75683 361 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 RBM25P49756 843 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 ATP8B2P98198 1209 aa13.61□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 DNAAF4Q8WXU2 420 aa13.61□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 GSE1Q14687 1217 aa13.6□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 TSHZ3Q63HK5 1081 aa13.6□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 RILPL2Q969X0 211 aa13.6□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 C1orf167Q5SNV9 1468 aa13.6□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 USP44Q9H0E7 712 aa13.6□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa13.6□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 CHMP5Q9NZZ3 219 aa13.6□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 NPHP3Q7Z494 1330 aa13.59□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 SRGAP3O43295 1099 aa13.58□□□□□ -0.23
RABGEF1-208ENST00000510829 PDE1AP54750 535 aa13.58□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC39A6Q13433 755 aa13.58□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 NWD1Q149M9 1564 aa13.58□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 SPG7Q9UQ90 795 aa13.58□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa13.58□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 HOXB7P09629 217 aa13.58□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa13.58□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa13.58□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 NFAT5O94916 1531 aa13.57□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 LTN1O94822 1766 aa13.57□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 ERBB3P21860 1342 aa13.57□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 REC8O95072 547 aa13.57□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 MX1P20591 662 aa13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 TTC5Q8N0Z6 440 aa13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 DDX58O95786 925 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 MYL6BP14649 208 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 NUTM1Q86Y26 1132 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 ANTXR1Q9H6X2 564 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 RIC3Q7Z5B4 369 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 ERC2O15083 957 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 ARXQ96QS3 562 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 PRDM11Q9NQV5 511 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 PROSER3Q2NL68 480 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 IFNL2Q8IZJ0 200 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 SNX21Q969T3 373 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 BEND3Q5T5X7 828 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 HYPKQ9NX55 129 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 HDAC5Q9UQL6 1122 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 RABEP1Q15276 862 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 KSR2Q6VAB6 950 aa13.52□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 USP26Q9BXU7 913 aa13.52□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 ANO2Q9NQ90 1003 aa13.52□□□□□ -0.24
RABGEF1-208ENST00000510829 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-208ENST00000510829 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF790Q6PG37 636 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-208ENST00000510829 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-208ENST00000510829 NEXNQ0ZGT2 675 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-208ENST00000510829 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-208ENST00000510829 PXDNQ92626 1479 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-208ENST00000510829 RAB11FIP3O75154 756 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-208ENST00000510829 MCCP23508 829 aa13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.1 ms