RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497115.5

ETV1-223, Transcript of ETS variant 1, human

TSL 4

Gene ETV1, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETV1-223	ENST00000497115	MTFR1	Q15390	333 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	GDF9	O60383	454 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	SCNN1A	P37088	669 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	FOXK2	Q01167	660 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115		Q6ZVU0	165 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	TNS4	Q8IZW8	715 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	XAGE2	Q96GT9	111 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	LGR5	O75473	907 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	SMTN	P53814	917 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115		A6NJY4	79 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	C21orf2	O43822	256 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	IL2RA	P01589	272 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	PRR20E	P86478	221 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	PRR20C	P86479	221 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	PRR20D	P86480	221 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	PRR20B	P86481	221 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	PRR20A	P86496	221 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	CLN3	Q13286	438 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	CYP4X1	Q8N118	509 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	ITPKC	Q96DU7	683 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	ICMT	O60725	284 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	NBPF15	Q8N660	670 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	CNKSR1	Q969H4	720 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	SEPT3	Q9UH03	358 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115		J3QL48	77 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	ABL1	P00519	1130 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	TIMP2	P16035	220 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	PTGIR	P43119	386 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	CBLB	Q13191	982 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	10.11	□□□□□ -0.79	2e-6	■■■■■ 96.1
ETV1-223	ENST00000497115		A0A1W2PRU2	124 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115		H3BRB1	525 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	CDK2AP1	O14519	115 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	SMPD1	P17405	629 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	ERCC3	P19447	782 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	TLR1	Q15399	786 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	POTEA	Q6S8J7	498 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ETV1-223	ENST00000497115	TNFRSF10A	O00220	468 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	10.08	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	MEIOB	Q8N635	442 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	NPR3	P17342	541 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	NLRP3	Q96P20	1036 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	CENPC	Q03188	943 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	TEAD4	Q15561	434 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	C16orf46	Q6P387	395 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	USP3	Q9Y6I4	520 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	GPC1	P35052	558 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	RELB	Q01201	579 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	ECM1	Q16610	540 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
ETV1-223	ENST00000497115	MYO19	Q96H55	970 aa		10.04	□□□□□ -0.8

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