RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa43.52■■■■■ 4.56
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CHKB-210ENST00000484266 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP43.52■■■■■ 4.56
CHKB-210ENST00000484266 ATG3Q9NT62 314 aa43.5■■■■■ 4.55
CHKB-210ENST00000484266 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
CHKB-210ENST00000484266 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
CHKB-210ENST00000484266 PAPPAQ13219 1627 aa43.48■■■■■ 4.55
CHKB-210ENST00000484266 LRRC4BQ9NT99 713 aa43.48■■■■■ 4.55
CHKB-210ENST00000484266 SLC27A3Q5K4L6 730 aa43.47■■■■■ 4.55
CHKB-210ENST00000484266 MCM10Q7L590 875 aa43.47■■■■■ 4.55
CHKB-210ENST00000484266 TMPOP42166 694 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
CHKB-210ENST00000484266 DCTN1Q14203 1278 aa43.45■■■■■ 4.55
CHKB-210ENST00000484266 KCNQ4P56696 695 aa43.43■■■■■ 4.54
CHKB-210ENST00000484266 TEFQ10587 303 aa43.43■■■■■ 4.54
CHKB-210ENST00000484266 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP43.43■■■■■ 4.54
CHKB-210ENST00000484266 TAF1LQ8IZX4 1826 aa43.41■■■■■ 4.54
CHKB-210ENST00000484266 RIPK4P57078 832 aa43.4■■■■■ 4.54
CHKB-210ENST00000484266 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
CHKB-210ENST00000484266 C5P01031 1676 aa43.38■■■■■ 4.54
CHKB-210ENST00000484266 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa43.38■■■■■ 4.53
CHKB-210ENST00000484266 SIK1P57059 783 aa43.38■■■■■ 4.53
CHKB-210ENST00000484266 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP43.38■■■■■ 4.53
CHKB-210ENST00000484266 ZNF831Q5JPB2 1677 aa43.36■■■■■ 4.53
CHKB-210ENST00000484266 NBPF14Q5TI25 921 aa43.36■■■■■ 4.53
CHKB-210ENST00000484266 UBR2Q8IWV8 1755 aa43.34■■■■■ 4.53
CHKB-210ENST00000484266 CCER2I3L3R5 266 aa43.34■■■■■ 4.53
CHKB-210ENST00000484266 SLC39A6Q13433 755 aa43.34■■■■■ 4.53
CHKB-210ENST00000484266 NEUROD2Q15784 382 aa43.34■■■■■ 4.53
CHKB-210ENST00000484266 APAF1O14727 1248 aa43.33■■■■■ 4.53
CHKB-210ENST00000484266 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
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CHKB-210ENST00000484266 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
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CHKB-210ENST00000484266 LMOD3Q0VAK6 560 aa43.31■■■■■ 4.52
CHKB-210ENST00000484266 FAM9BQ8IZU0 186 aa43.31■■■■■ 4.52
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CHKB-210ENST00000484266 MIER1Q8N108 512 aa43.29■■■■■ 4.52
CHKB-210ENST00000484266 ATP6V1AP38606 617 aa43.28■■■■■ 4.52
CHKB-210ENST00000484266 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
CHKB-210ENST00000484266 TRIM35Q9UPQ4 493 aa43.28■■■■■ 4.52
CHKB-210ENST00000484266 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP43.27■■■■■ 4.52
CHKB-210ENST00000484266 BTBD11A6QL63 1104 aa43.27■■■■■ 4.52
CHKB-210ENST00000484266 ITPK1Q13572 414 aa43.27■■■■■ 4.52
CHKB-210ENST00000484266 STK32BQ9NY57 414 aa43.27■■■■■ 4.52
CHKB-210ENST00000484266 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP43.26■■■■■ 4.52
CHKB-210ENST00000484266 SLC15A2Q16348 729 aa43.26■■■■■ 4.52
CHKB-210ENST00000484266 ZNF827Q17R98 1081 aa43.26■■■■■ 4.52
CHKB-210ENST00000484266 C4BP0C0L5 1744 aa43.26■■■■■ 4.52
CHKB-210ENST00000484266 ZNF790Q6PG37 636 aa43.25■■■■■ 4.51
CHKB-210ENST00000484266 TJP1Q07157 1748 aa43.25■■■■■ 4.51
CHKB-210ENST00000484266 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP43.24■■■■■ 4.51
CHKB-210ENST00000484266 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP43.24■■■■■ 4.51
CHKB-210ENST00000484266 AKT1S1Q96B36 256 aa43.24■■■■■ 4.51
CHKB-210ENST00000484266 TTC5Q8N0Z6 440 aa43.23■■■■■ 4.51
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CHKB-210ENST00000484266 LINC00116Q8NCU8 138 aa43.22■■■■■ 4.51
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CHKB-210ENST00000484266 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP43.17■■■■■ 4.5
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CHKB-210ENST00000484266 VSIG10Q8N0Z9 540 aa43.13■■■■■ 4.49
CHKB-210ENST00000484266 UBR3Q6ZT12 1888 aa43.12■■■■■ 4.49
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CHKB-210ENST00000484266 FMNL2Q96PY5 1086 aa43.12■■■■■ 4.49
CHKB-210ENST00000484266 DNAJC10Q8IXB1 793 aa43.11■■■■■ 4.49
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CHKB-210ENST00000484266 TSPYL4Q9UJ04 414 aa43.05■■■■■ 4.48
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CHKB-210ENST00000484266 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP43.02■■■■■ 4.48
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CHKB-210ENST00000484266 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
CHKB-210ENST00000484266 SMIM5Q71RC9 77 aa42.97■■■■■ 4.47
CHKB-210ENST00000484266 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP42.97■■■■■ 4.47
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CHKB-210ENST00000484266 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
CHKB-210ENST00000484266 CCDC87Q9NVE4 849 aa42.95■■■■■ 4.47
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