RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, human

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SZRD1-208	ENST00000476423	RASSF10	A6NK89	507 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SZRD1-208	ENST00000476423	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SZRD1-208	ENST00000476423	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SZRD1-208	ENST00000476423	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SZRD1-208	ENST00000476423	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SZRD1-208	ENST00000476423	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SZRD1-208	ENST00000476423	POTEC	B2RU33	542 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SZRD1-208	ENST00000476423	SMIM5	Q71RC9	77 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SZRD1-208	ENST00000476423	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SZRD1-208	ENST00000476423	CA12	O43570	354 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SZRD1-208	ENST00000476423	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SZRD1-208	ENST00000476423	PASK	Q96RG2	1323 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SZRD1-208	ENST00000476423	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
SZRD1-208	ENST00000476423	ECE1	P42892	770 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SZRD1-208	ENST00000476423	LDHD	Q86WU2	507 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SZRD1-208	ENST00000476423	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SZRD1-208	ENST00000476423	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		11.27	□□□□□ -0.6
SZRD1-208	ENST00000476423	LTN1	O94822	1766 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	GNPAT	O15228	680 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	DGKZ	Q13574	1117 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	NBPF15	Q8N660	670 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	DLL1	O00548	723 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	RASSF7	Q02833	373 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	C4A	P0C0L4	1744 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	RFC4	P35249	363 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	MAP2K2	P36507	400 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	SIK1	P57059	783 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	IP6K1	Q92551	441 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	USP31	Q70CQ4	1352 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	ATP6V1A	P38606	617 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	ERFE	Q4G0M1	354 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SZRD1-208	ENST00000476423	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	GYS1	P13807	737 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	CAPNS2	Q96L46	248 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	EVC2	Q86UK5	1308 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	POTEI	P0CG38	1075 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	POTEJ	P0CG39	1038 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	CHRNA5	P30532	468 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	SOX10	P56693	466 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	TTLL6	Q8N841	843 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	CNTROB	Q8N137	903 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	RPS6KA4	O75676	772 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	NME9	Q86XW9	330 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	PIGB	Q92521	554 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	TSKS	Q9UJT2	592 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	SCN4A	P35499	1836 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SZRD1-208	ENST00000476423	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SZRD1-208	ENST00000476423	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SZRD1-208	ENST00000476423	NFKBIE	O00221	500 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SZRD1-208	ENST00000476423	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SZRD1-208	ENST00000476423	GRM1	Q13255	1194 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SZRD1-208	ENST00000476423	ITPK1	Q13572	414 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SZRD1-208	ENST00000476423	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SZRD1-208	ENST00000476423	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SZRD1-208	ENST00000476423	AMPH	P49418	695 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SZRD1-208	ENST00000476423	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SZRD1-208	ENST00000476423	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SZRD1-208	ENST00000476423	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
SZRD1-208	ENST00000476423	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SZRD1-208	ENST00000476423	HACL1	Q9UJ83	578 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SZRD1-208	ENST00000476423	MEGF6	O75095	1541 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SZRD1-208	ENST00000476423		A0A1W2PP64	1363 aa		11.13	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms