RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 CDCA7LQ96GN5 454 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 RGS12O14924 1447 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 MRC1P22897 1456 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 SCN11AQ9UI33 1791 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 FANCIQ9NVI1 1328 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 DUSP27Q5VZP5 1158 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 TTC5Q8N0Z6 440 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 PIGBQ92521 554 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 ACSBG1Q96GR2 724 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 MBIPQ9NS73 344 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM182BQ5T319 152 aa12.17□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 MIS18AQ9NYP9 233 aa12.17□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF790Q6PG37 636 aa12.16□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 KAT6BQ8WYB5 2073 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNQ2O43526 872 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC39A6Q13433 755 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 CHMP4AQ9BY43 222 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 BRWD3Q6RI45 1802 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 FMNL2Q96PY5 1086 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNQ3O43525 872 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 ATG3Q9NT62 314 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 ASAP1Q9ULH1 1129 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 DOT1LQ8TEK3 1739 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM37O94972 964 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 HOXB7P09629 217 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF428Q96B54 188 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 VSIG10Q8N0Z9 540 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 C8orf58Q8NAV2 365 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 ITGB4P16144 1822 aa12.11□□□□□ -0.47
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SH3BP4-208ENST00000462602 PALLDQ8WX93 1383 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 HEG1Q9ULI3 1381 aa12.1□□□□□ -0.47
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SH3BP4-208ENST00000462602 PTF1AQ7RTS3 328 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 SIK1P57059 783 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC30Q5VVM6 783 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 RCAN3Q9UKA8 241 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 PAPPAQ13219 1627 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 KCPQ6ZWJ8 1503 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 SBF2Q86WG5 1849 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 STARD3NLO95772 234 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 APBA3O96018 575 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP6V1AP38606 617 aa12.07□□□□□ -0.48
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SH3BP4-208ENST00000462602 ALDH1L2Q3SY69 923 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 PLSCR1O15162 318 aa12.06□□□□□ -0.48
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SH3BP4-208ENST00000462602 SLC27A3Q5K4L6 730 aa12.06□□□□□ -0.48
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SH3BP4-208ENST00000462602 STK31Q9BXU1 1019 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 BTAF1O14981 1849 aa12.05□□□□□ -0.48
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SH3BP4-208ENST00000462602 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 SSH1Q8WYL5 1049 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC4A9Q96Q91 983 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 SMC4Q9NTJ3 1288 aa12.04□□□□□ -0.48
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SH3BP4-208ENST00000462602 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 BAG6P46379 1132 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 NECTIN2Q92692 538 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC4A2P04920 1241 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP4-208ENST00000462602 ITPK1Q13572 414 aa12.02□□□□□ -0.49
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SH3BP4-208ENST00000462602 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP12.02□□□□□ -0.49
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