RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.55■■□□□ 1.68
SNHG12-201ENST00000461448 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
SNHG12-201ENST00000461448 MRC1P22897 1456 aa25.54■■□□□ 1.68
SNHG12-201ENST00000461448 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
SNHG12-201ENST00000461448 ITGB4P16144 1822 aa25.53■■□□□ 1.68
SNHG12-201ENST00000461448 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
SNHG12-201ENST00000461448 APBA3O96018 575 aa25.53■■□□□ 1.68
SNHG12-201ENST00000461448 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
SNHG12-201ENST00000461448 BTBD11A6QL63 1104 aa25.52■■□□□ 1.68
SNHG12-201ENST00000461448 WDR63Q8IWG1 891 aa25.52■■□□□ 1.68
SNHG12-201ENST00000461448 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.52■■□□□ 1.68
SNHG12-201ENST00000461448 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.52■■□□□ 1.68
SNHG12-201ENST00000461448 SLC39A6Q13433 755 aa25.51■■□□□ 1.67
SNHG12-201ENST00000461448 ATG3Q9NT62 314 aa25.5■■□□□ 1.67
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC125Q86Z20 511 aa25.49■■□□□ 1.67
SNHG12-201ENST00000461448 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
SNHG12-201ENST00000461448 EP400Q96L91 3159 aa25.49■■□□□ 1.67
SNHG12-201ENST00000461448 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF521Q96K83 1311 aa25.48■■□□□ 1.67
SNHG12-201ENST00000461448 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.48■■□□□ 1.67
SNHG12-201ENST00000461448 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.48■■□□□ 1.67
SNHG12-201ENST00000461448 IL16Q14005 1332 aa25.47■■□□□ 1.67
SNHG12-201ENST00000461448 BTAF1O14981 1849 aa25.47■■□□□ 1.67
SNHG12-201ENST00000461448 GOLGA2Q08379 1002 aa25.47■■□□□ 1.67
SNHG12-201ENST00000461448 GNAI1P63096 354 aa25.46■■□□□ 1.67
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF790Q6PG37 636 aa25.46■■□□□ 1.67
SNHG12-201ENST00000461448 CFAP44Q96MT7 982 aa25.46■■□□□ 1.67
SNHG12-201ENST00000461448 KCNQ3O43525 872 aa25.45■■□□□ 1.67
SNHG12-201ENST00000461448 IFT57Q9NWB7 429 aa25.45■■□□□ 1.67
SNHG12-201ENST00000461448 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 PALLDQ8WX93 1383 aa25.45■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 CHL1O00533 1208 aa25.45■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 BAG6P46379 1132 aa25.45■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.45■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 PLSCR1O15162 318 aa25.43■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF853P0CG23 659 aa25.43■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.42■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 E9PSI1 815 aa25.41■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 MBIPQ9NS73 344 aa25.41■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.41■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.39■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 SIK1P57059 783 aa25.39■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.39■■□□□ 1.66
SNHG12-201ENST00000461448 PAPPAQ13219 1627 aa25.38■■□□□ 1.65
SNHG12-201ENST00000461448 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SNHG12-201ENST00000461448 TXNRD1Q16881 649 aa25.37■■□□□ 1.65
SNHG12-201ENST00000461448 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.37■■□□□ 1.65
SNHG12-201ENST00000461448 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.37■■□□□ 1.65
SNHG12-201ENST00000461448 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SNHG12-201ENST00000461448 ATP6V1AP38606 617 aa25.37■■□□□ 1.65
SNHG12-201ENST00000461448 KCNQ4P56696 695 aa25.37■■□□□ 1.65
SNHG12-201ENST00000461448 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SNHG12-201ENST00000461448 SLFN5Q08AF3 891 aa25.36■■□□□ 1.65
SNHG12-201ENST00000461448 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.36■■□□□ 1.65
SNHG12-201ENST00000461448 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.35■■□□□ 1.65
SNHG12-201ENST00000461448 PROM2Q8N271 834 aa25.35■■□□□ 1.65
SNHG12-201ENST00000461448 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.35■■□□□ 1.65
SNHG12-201ENST00000461448 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.34■■□□□ 1.65
SNHG12-201ENST00000461448 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.34■■□□□ 1.65
SNHG12-201ENST00000461448 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.34■■□□□ 1.65
SNHG12-201ENST00000461448 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.33■■□□□ 1.65
SNHG12-201ENST00000461448 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SNHG12-201ENST00000461448 KRT24Q2M2I5 525 aa25.32■■□□□ 1.64
SNHG12-201ENST00000461448 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.32■■□□□ 1.64
SNHG12-201ENST00000461448 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.32■■□□□ 1.64
SNHG12-201ENST00000461448 LY75O60449 1722 aa25.31■■□□□ 1.64
SNHG12-201ENST00000461448 ITPK1Q13572 414 aa25.31■■□□□ 1.64
SNHG12-201ENST00000461448 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.31■■□□□ 1.64
SNHG12-201ENST00000461448 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SNHG12-201ENST00000461448 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.3■■□□□ 1.64
SNHG12-201ENST00000461448 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SNHG12-201ENST00000461448 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SNHG12-201ENST00000461448 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SNHG12-201ENST00000461448 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SNHG12-201ENST00000461448 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.28■■□□□ 1.64
SNHG12-201ENST00000461448 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SNHG12-201ENST00000461448 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.28■■□□□ 1.64
SNHG12-201ENST00000461448 SOCS7O14512 581 aa25.27■■□□□ 1.64
SNHG12-201ENST00000461448 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.27■■□□□ 1.64
SNHG12-201ENST00000461448 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.26■■□□□ 1.63
SNHG12-201ENST00000461448 USP16Q9Y5T5 823 aa25.26■■□□□ 1.63
SNHG12-201ENST00000461448 STARD3NLO95772 234 aa25.25■■□□□ 1.63
SNHG12-201ENST00000461448 TSPYL6Q8N831 410 aa25.25■■□□□ 1.63
SNHG12-201ENST00000461448 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SNHG12-201ENST00000461448 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SNHG12-201ENST00000461448 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SNHG12-201ENST00000461448 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.23■■□□□ 1.63
SNHG12-201ENST00000461448 TJP1Q07157 1748 aa25.23■■□□□ 1.63
SNHG12-201ENST00000461448 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.23■■□□□ 1.63
SNHG12-201ENST00000461448 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SNHG12-201ENST00000461448 HOXB7P09629 217 aa25.22■■□□□ 1.63
SNHG12-201ENST00000461448 NECTIN2Q92692 538 aa25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.2 ms