RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 GNAI3P08754 354 aa34.27■■■■□ 3.08
CERS1-201ENST00000429504 KIF2CQ99661 725 aa34.27■■■■□ 3.08
CERS1-201ENST00000429504 ARHGEF25Q86VW2 580 aa34.26■■■■□ 3.08
CERS1-201ENST00000429504 GCP02774 474 aa34.26■■■■□ 3.07
CERS1-201ENST00000429504 CHMP5Q9NZZ3 219 aa34.24■■■■□ 3.07
CERS1-201ENST00000429504 HOXB7P09629 217 aa34.24■■■■□ 3.07
CERS1-201ENST00000429504 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa34.24■■■■□ 3.07
CERS1-201ENST00000429504 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
CERS1-201ENST00000429504 NECTIN2Q92692 538 aa34.23■■■■□ 3.07
CERS1-201ENST00000429504 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
CERS1-201ENST00000429504 AKAP4Q5JQC9 854 aa34.22■■■■□ 3.07
CERS1-201ENST00000429504 CHMP4AQ9BY43 222 aa34.22■■■■□ 3.07
CERS1-201ENST00000429504 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa34.21■■■■□ 3.07
CERS1-201ENST00000429504 MST1RQ04912 1400 aa34.21■■■■□ 3.07
CERS1-201ENST00000429504 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa34.21■■■■□ 3.07
CERS1-201ENST00000429504 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
CERS1-201ENST00000429504 ZBTB7CA1YPR0 619 aa34.2■■■■□ 3.07
CERS1-201ENST00000429504 AMOTQ4VCS5 1084 aa34.2■■■■□ 3.07
CERS1-201ENST00000429504 OSBPL3Q9H4L5 887 aa34.2■■■■□ 3.07
CERS1-201ENST00000429504 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
CERS1-201ENST00000429504 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
CERS1-201ENST00000429504 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.19■■■■□ 3.06
CERS1-201ENST00000429504 APBB1O00213 710 aa34.19■■■■□ 3.06
CERS1-201ENST00000429504 LGR6Q9HBX8 967 aa34.19■■■■□ 3.06
CERS1-201ENST00000429504 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa34.18■■■■□ 3.06
CERS1-201ENST00000429504 SDSP20132 328 aa34.18■■■■□ 3.06
CERS1-201ENST00000429504 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
CERS1-201ENST00000429504 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
CERS1-201ENST00000429504 ALS2Q96Q42 1657 aa34.17■■■■□ 3.06
CERS1-201ENST00000429504 ATP8B2P98198 1209 aa34.16■■■■□ 3.06
CERS1-201ENST00000429504 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
CERS1-201ENST00000429504 DDIT3P35638 169 aa34.16■■■■□ 3.06
CERS1-201ENST00000429504 CASC1Q6TDU7 716 aa34.15■■■■□ 3.06
CERS1-201ENST00000429504 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.15■■■■□ 3.06
CERS1-201ENST00000429504 TEFQ10587 303 aa34.14■■■■□ 3.06
CERS1-201ENST00000429504 PXDNQ92626 1479 aa34.14■■■■□ 3.06
CERS1-201ENST00000429504 RGPD5Q99666 1765 aa34.14■■■■□ 3.06
CERS1-201ENST00000429504 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.13■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 C19orf44Q9H6X5 657 aa34.13■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 ANKRD24Q8TF21 1146 aa34.13■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 USP44Q9H0E7 712 aa34.13■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 PDE1AP54750 535 aa34.11■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa34.11■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa34.1■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 LRRCC1Q9C099 1032 aa34.1■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 SALL3Q9BXA9 1300 aa34.1■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa34.1■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 C1orf141Q5JVX7 400 aa34.1■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 LMOD2Q6P5Q4 547 aa34.1■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 USP26Q9BXU7 913 aa34.1■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 BTBD11A6QL63 1104 aa34.09■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 RNMTO43148 476 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
CERS1-201ENST00000429504 MCM4P33991 863 aa34.07■■■■□ 3.04
CERS1-201ENST00000429504 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa34.07■■■■□ 3.04
CERS1-201ENST00000429504 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
CERS1-201ENST00000429504 HSPA2P54652 639 aa34.07■■■■□ 3.04
CERS1-201ENST00000429504 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa34.07■■■■□ 3.04
CERS1-201ENST00000429504 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
CERS1-201ENST00000429504 RABEP1Q15276 862 aa34.06■■■■□ 3.04
CERS1-201ENST00000429504 CHPF2Q9P2E5 772 aa34.06■■■■□ 3.04
CERS1-201ENST00000429504 KCNQ3O43525 872 aa34.05■■■■□ 3.04
CERS1-201ENST00000429504 AXIN2Q9Y2T1 843 aa34.05■■■■□ 3.04
CERS1-201ENST00000429504 DCCP43146 1447 aa34.04■■■■□ 3.04
CERS1-201ENST00000429504 REC8O95072 547 aa34.03■■■■□ 3.04
CERS1-201ENST00000429504 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
CERS1-201ENST00000429504 SSH3Q8TE77 659 aa34.03■■■■□ 3.04
CERS1-201ENST00000429504 ERBB3P21860 1342 aa34.02■■■■□ 3.04
CERS1-201ENST00000429504 HEG1Q9ULI3 1381 aa34.02■■■■□ 3.04
CERS1-201ENST00000429504 MX1P20591 662 aa34.01■■■■□ 3.04
CERS1-201ENST00000429504 DNAAF4Q8WXU2 420 aa34.01■■■■□ 3.04
CERS1-201ENST00000429504 STRCP1A6NGW2 1772 aa34■■■■□ 3.03
CERS1-201ENST00000429504 ERC2O15083 957 aa33.99■■■■□ 3.03
CERS1-201ENST00000429504 STAP2Q9UGK3 403 aa33.99■■■■□ 3.03
CERS1-201ENST00000429504 PLEKHG5O94827 1062 aa33.99■■■■□ 3.03
CERS1-201ENST00000429504 BEND3Q5T5X7 828 aa33.99■■■■□ 3.03
CERS1-201ENST00000429504 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
CERS1-201ENST00000429504 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa33.99■■■■□ 3.03
CERS1-201ENST00000429504 PI4KAP2A4QPH2 592 aa33.97■■■■□ 3.03
CERS1-201ENST00000429504 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
CERS1-201ENST00000429504 POLA2Q14181 598 aa33.97■■■■□ 3.03
CERS1-201ENST00000429504 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa33.97■■■■□ 3.03
CERS1-201ENST00000429504 AOX1Q06278 1338 aa33.97■■■■□ 3.03
CERS1-201ENST00000429504 ADCY9O60503 1353 aa33.96■■■■□ 3.03
CERS1-201ENST00000429504 SCN11AQ9UI33 1791 aa33.96■■■■□ 3.03
CERS1-201ENST00000429504 RAB11FIP3O75154 756 aa33.95■■■■□ 3.03
CERS1-201ENST00000429504 ATF3P18847 181 aa33.95■■■■□ 3.03
CERS1-201ENST00000429504 ABCC6O95255 1503 aa33.95■■■■□ 3.03
CERS1-201ENST00000429504 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
CERS1-201ENST00000429504 TMEM94Q12767 1356 aa33.95■■■■□ 3.02
CERS1-201ENST00000429504 COL18A1P39060 1754 aa33.95■■■■□ 3.02
CERS1-201ENST00000429504 DDX11L8A8MPP1 907 aa33.94■■■■□ 3.02
CERS1-201ENST00000429504 RAB3GAP1Q15042 981 aa33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms