RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	PTGER2	P43116	358 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	SCN7A	Q01118	1682 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	ATG3	Q9NT62	314 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	MAP3K5	Q99683	1374 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		13.8	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	PRKAR2B	P31323	418 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	SIK1	P57059	783 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	MSL1	Q68DK7	614 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	LGR6	Q9HBX8	967 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	PHF14	O94880	888 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	DCAF5	Q96JK2	942 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HDLBP-216	ENST00000428482	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	SPON1	Q9HCB6	807 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	MTFR1L	Q9H019	292 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	CABP4	P57796	275 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	SLC39A6	Q13433	755 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	AK7	Q96M32	723 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	CFAP53	Q96M91	514 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	GNPAT	O15228	680 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	ATP6V1A	P38606	617 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	MSH5	O43196	834 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	DCTN1	Q14203	1278 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-216	ENST00000428482	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	MCM10	Q7L590	875 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	KLHL34	Q8N239	644 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	KCNQ3	O43525	872 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	ARX	Q96QS3	562 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	CACNA1S	Q13698	1873 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	SSFA2	P28290	1259 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	COL15A1	P39059	1388 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	CHD4	Q14839	1912 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	RALBP1	Q15311	655 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	CCDC184	Q52MB2	194 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	NUDC	Q9Y266	331 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDLBP-216	ENST00000428482	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	SYT17	Q9BSW7	474 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	FCHSD2	O94868	740 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	POLD1	P28340	1107 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	TEF	Q10587	303 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23

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