RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428445.1

VARS-216, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene VARS, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-216ENST00000428445 SSFA2P28290 1259 aa22.8■■□□□ 1.24
VARS-216ENST00000428445 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.8■■□□□ 1.24
VARS-216ENST00000428445 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
VARS-216ENST00000428445 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
VARS-216ENST00000428445 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
VARS-216ENST00000428445 ATP10DQ9P241 1426 aa22.78■■□□□ 1.24
VARS-216ENST00000428445 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
VARS-216ENST00000428445 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.76■■□□□ 1.23
VARS-216ENST00000428445 MMP10P09238 476 aa22.74■■□□□ 1.23
VARS-216ENST00000428445 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
VARS-216ENST00000428445 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
VARS-216ENST00000428445 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.72■■□□□ 1.23
VARS-216ENST00000428445 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.72■■□□□ 1.23
VARS-216ENST00000428445 KDRP35968 1356 aa22.72■■□□□ 1.23
VARS-216ENST00000428445 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
VARS-216ENST00000428445 MORC1Q86VD1 984 aa22.71■■□□□ 1.23
VARS-216ENST00000428445 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
VARS-216ENST00000428445 DCAF5Q96JK2 942 aa22.71■■□□□ 1.23
VARS-216ENST00000428445 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
VARS-216ENST00000428445 CABP4P57796 275 aa22.7■■□□□ 1.22
VARS-216ENST00000428445 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
VARS-216ENST00000428445 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
VARS-216ENST00000428445 CEP350Q5VT06 3117 aa22.69■■□□□ 1.22
VARS-216ENST00000428445 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
VARS-216ENST00000428445 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
VARS-216ENST00000428445 ADCY9O60503 1353 aa22.68■■□□□ 1.22
VARS-216ENST00000428445 A0A0G2JLW4 131 aa22.68■■□□□ 1.22
VARS-216ENST00000428445 MTHFSP49914 203 aa22.68■■□□□ 1.22
VARS-216ENST00000428445 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.68■■□□□ 1.22
VARS-216ENST00000428445 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
VARS-216ENST00000428445 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.67■■□□□ 1.22
VARS-216ENST00000428445 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
VARS-216ENST00000428445 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
VARS-216ENST00000428445 RPS6KA4O75676 772 aa22.65■■□□□ 1.22
VARS-216ENST00000428445 GYS1P13807 737 aa22.65■■□□□ 1.22
VARS-216ENST00000428445 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.65■■□□□ 1.22
VARS-216ENST00000428445 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
VARS-216ENST00000428445 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.65■■□□□ 1.22
VARS-216ENST00000428445 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.65■■□□□ 1.22
VARS-216ENST00000428445 IL13P35225 146 aa22.64■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 RFC4P35249 363 aa22.64■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.64■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.64■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 BCS1LQ9Y276 419 aa22.64■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.63■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.63■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 DPEP1P16444 411 aa22.62■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.62■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.62■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 C4AP0C0L4 1744 aa22.6■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 TGFB2P61812 414 aa22.6■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 LGR6Q9HBX8 967 aa22.6■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.6■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.6■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 ADRA2BP18089 450 aa22.59■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.59■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.58■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 KIF3CO14782 793 aa22.58■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 HMOX1P09601 288 aa22.58■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 FKBP8Q14318 412 aa22.58■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.58■■□□□ 1.21
VARS-216ENST00000428445 KCNA3P22001 575 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-216ENST00000428445 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-216ENST00000428445 TJP1Q07157 1748 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-216ENST00000428445 FCHSD2O94868 740 aa22.56■■□□□ 1.2
VARS-216ENST00000428445 SLC39A6Q13433 755 aa22.56■■□□□ 1.2
VARS-216ENST00000428445 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
VARS-216ENST00000428445 DDR1Q08345 913 aa22.55■■□□□ 1.2
VARS-216ENST00000428445 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
VARS-216ENST00000428445 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.55■■□□□ 1.2
VARS-216ENST00000428445 HSPA6P17066 643 aa22.54■■□□□ 1.2
VARS-216ENST00000428445 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.54■■□□□ 1.2
VARS-216ENST00000428445 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.54■■□□□ 1.2
VARS-216ENST00000428445 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
VARS-216ENST00000428445 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
VARS-216ENST00000428445 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
VARS-216ENST00000428445 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.52■■□□□ 1.2
VARS-216ENST00000428445 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
VARS-216ENST00000428445 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
VARS-216ENST00000428445 CHRNA5P30532 468 aa22.51■■□□□ 1.19
VARS-216ENST00000428445 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
VARS-216ENST00000428445 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.5■■□□□ 1.19
VARS-216ENST00000428445 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.49■■□□□ 1.19
VARS-216ENST00000428445 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.49■■□□□ 1.19
VARS-216ENST00000428445 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
VARS-216ENST00000428445 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
VARS-216ENST00000428445 TM4SF1P30408 202 aa22.48■■□□□ 1.19
VARS-216ENST00000428445 PIM2Q9P1W9 311 aa22.48■■□□□ 1.19
VARS-216ENST00000428445 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
VARS-216ENST00000428445 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.47■■□□□ 1.19
VARS-216ENST00000428445 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
VARS-216ENST00000428445 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
VARS-216ENST00000428445 ZPR1O75312 459 aa22.45■■□□□ 1.18
VARS-216ENST00000428445 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.45■■□□□ 1.18
VARS-216ENST00000428445 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.45■■□□□ 1.18
VARS-216ENST00000428445 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
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