RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 ATG3Q9NT62 314 aa23.93■■□□□ 1.42
SEMA3B-201ENST00000416295 MRC1P22897 1456 aa23.93■■□□□ 1.42
SEMA3B-201ENST00000416295 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.92■■□□□ 1.42
SEMA3B-201ENST00000416295 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.92■■□□□ 1.42
SEMA3B-201ENST00000416295 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.91■■□□□ 1.42
SEMA3B-201ENST00000416295 SIK1P57059 783 aa23.91■■□□□ 1.42
SEMA3B-201ENST00000416295 ANP32CO43423 234 aa23.9■■□□□ 1.42
SEMA3B-201ENST00000416295 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.89■■□□□ 1.41
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF827Q17R98 1081 aa23.89■■□□□ 1.41
SEMA3B-201ENST00000416295 AKT1S1Q96B36 256 aa23.89■■□□□ 1.41
SEMA3B-201ENST00000416295 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.89■■□□□ 1.41
SEMA3B-201ENST00000416295 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.88■■□□□ 1.41
SEMA3B-201ENST00000416295 C5P01031 1676 aa23.87■■□□□ 1.41
SEMA3B-201ENST00000416295 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
SEMA3B-201ENST00000416295 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SEMA3B-201ENST00000416295 ZBTB7AO95365 584 aa23.86■■□□□ 1.41
SEMA3B-201ENST00000416295 TEFQ10587 303 aa23.86■■□□□ 1.41
SEMA3B-201ENST00000416295 IL17REQ8NFR9 667 aa23.86■■□□□ 1.41
SEMA3B-201ENST00000416295 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.86■■□□□ 1.41
SEMA3B-201ENST00000416295 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.86■■□□□ 1.41
SEMA3B-201ENST00000416295 ATP6V1AP38606 617 aa23.85■■□□□ 1.41
SEMA3B-201ENST00000416295 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SEMA3B-201ENST00000416295 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
SEMA3B-201ENST00000416295 MTFR1LQ9H019 292 aa23.84■■□□□ 1.41
SEMA3B-201ENST00000416295 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
SEMA3B-201ENST00000416295 NFE2L2Q16236 605 aa23.83■■□□□ 1.41
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.83■■□□□ 1.4
SEMA3B-201ENST00000416295 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.82■■□□□ 1.4
SEMA3B-201ENST00000416295 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
SEMA3B-201ENST00000416295 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.82■■□□□ 1.4
SEMA3B-201ENST00000416295 ITPK1Q13572 414 aa23.81■■□□□ 1.4
SEMA3B-201ENST00000416295 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.81■■□□□ 1.4
SEMA3B-201ENST00000416295 AK7Q96M32 723 aa23.81■■□□□ 1.4
SEMA3B-201ENST00000416295 C4BP0C0L5 1744 aa23.81■■□□□ 1.4
SEMA3B-201ENST00000416295 PTGER2P43116 358 aa23.8■■□□□ 1.4
SEMA3B-201ENST00000416295 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.8■■□□□ 1.4
SEMA3B-201ENST00000416295 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
SEMA3B-201ENST00000416295 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.8■■□□□ 1.4
SEMA3B-201ENST00000416295 MCM10Q7L590 875 aa23.79■■□□□ 1.4
SEMA3B-201ENST00000416295 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.79■■□□□ 1.4
SEMA3B-201ENST00000416295 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.79■■□□□ 1.4
SEMA3B-201ENST00000416295 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.79■■□□□ 1.4
SEMA3B-201ENST00000416295 SLC39A6Q13433 755 aa23.78■■□□□ 1.4
SEMA3B-201ENST00000416295 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.77■■□□□ 1.4
SEMA3B-201ENST00000416295 RUNDC1Q96C34 613 aa23.77■■□□□ 1.4
SEMA3B-201ENST00000416295 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.76■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 DCTN1Q14203 1278 aa23.76■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.76■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.76■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 BTBD11A6QL63 1104 aa23.75■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF790Q6PG37 636 aa23.75■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.75■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.74■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.74■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.74■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 GNPATO15228 680 aa23.73■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 SSFA2P28290 1259 aa23.73■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 RIPK4P57078 832 aa23.73■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 CCDC184Q52MB2 194 aa23.73■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.73■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 MRS2Q9HD23 443 aa23.73■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 MSH5O43196 834 aa23.72■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.72■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.72■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 TJP1Q07157 1748 aa23.71■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
SEMA3B-201ENST00000416295 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.7■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 ARXQ96QS3 562 aa23.7■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.69■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.69■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 PHF14O94880 888 aa23.69■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.69■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.68■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 RPS6KA4O75676 772 aa23.67■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 ADRA2BP18089 450 aa23.67■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 POLD1P28340 1107 aa23.67■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 SYT17Q9BSW7 474 aa23.67■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 NEUROD2Q15784 382 aa23.66■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.66■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 KCNQ3O43525 872 aa23.65■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 STARD3NLO95772 234 aa23.65■■□□□ 1.38
SEMA3B-201ENST00000416295 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.64■■□□□ 1.37
SEMA3B-201ENST00000416295 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
SEMA3B-201ENST00000416295 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms