RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 ITPK1Q13572 414 aa24.32■■□□□ 1.48
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PTPRN2-204ENST00000404321 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.31■■□□□ 1.48
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PTPRN2-204ENST00000404321 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.28■■□□□ 1.48
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PTPRN2-204ENST00000404321 MAP3K5Q99683 1374 aa24.26■■□□□ 1.47
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PTPRN2-204ENST00000404321 RFC4P35249 363 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.07■■□□□ 1.44
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PTPRN2-204ENST00000404321 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRN2-204ENST00000404321 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.05■■□□□ 1.44
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PTPRN2-204ENST00000404321 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRN2-204ENST00000404321 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRN2-204ENST00000404321 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PTPRN2-204ENST00000404321 MMP10P09238 476 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRN2-204ENST00000404321 GYS1P13807 737 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRN2-204ENST00000404321 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PTPRN2-204ENST00000404321 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PTPRN2-204ENST00000404321 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PTPRN2-204ENST00000404321 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PTPRN2-204ENST00000404321 UBR2Q8IWV8 1755 aa24■■□□□ 1.43
PTPRN2-204ENST00000404321 STARD3NLO95772 234 aa24■■□□□ 1.43
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