RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 ZMYM3Q14202 1370 aa8.31□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.31□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 GDF11O95390 407 aa8.3□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 BRICD5Q6PL45 260 aa8.3□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.3□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 A2ML1A8K2U0 1454 aa8.3□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 TMF1P82094 1093 aa8.29□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 RASSF7Q02833 373 aa8.29□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 ATP6V1AP38606 617 aa8.28□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 FUT2Q10981 343 aa8.28□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 XP32Q5T750 250 aa8.28□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 CDCA8Q53HL2 280 aa8.27□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.27□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa8.27□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 TNRQ92752 1358 aa8.26□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 MLECQ14165 292 aa8.26□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 LMTK3Q96Q04 1460 aa8.26□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 MYO5BQ9ULV0 1848 aa8.25□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 ALDH1A1P00352 501 aa8.25□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 FECHP22830 423 aa8.25□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 MMP16P51512 607 aa8.25□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 RIMS2Q9UQ26 1411 aa8.25□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 NLRP1Q9C000 1473 aa8.25□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 OATP04181 439 aa8.24□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 WNT7BP56706 349 aa8.24□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 SKOR1P84550 965 aa8.24□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 RALBP1Q15311 655 aa8.24□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.24□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 ALKQ9UM73 1620 aa8.24□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 PARD3Q8TEW0 1356 aa8.23□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa8.23□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.23□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 PTPRMP28827 1452 aa8.23□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 DLC1Q96QB1 1528 aa8.23□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 MYOM1P52179 1685 aa8.22□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC184Q52MB2 194 aa8.22□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM132EQ6IEE7 984 aa8.22□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 ZFP42Q96MM3 310 aa8.22□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 PANK3Q9H999 370 aa8.22□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 WDR70Q9NW82 654 aa8.22□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM2Q9UHN6 1383 aa8.22□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGAP23Q9P227 1491 aa8.21□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 UBR1Q8IWV7 1749 aa8.21□□□□□ -1.09
C6orf48-208ENST00000395788 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 RDH13Q8NBN7 331 aa8.21□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 POLR3GLQ9BT43 218 aa8.21□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa8.21□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 ABCC11Q96J66 1382 aa8.21□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 C3P01024 1663 aa8.21□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 SLIT1O75093 1534 aa8.2□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 IGHA1P01876 353 aa8.2□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 SIRT1Q96EB6 747 aa8.2□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.2□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 QRICH2Q9H0J4 1663 aa8.2□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 TECPR2O15040 1411 aa8.2□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 MED14O60244 1454 aa8.19□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 TULP4Q9NRJ4 1543 aa8.19□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa8.19□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 INSRP06213 1382 aa8.19□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 SIAH2O43255 324 aa8.18□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 GCGRP47871 477 aa8.18□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 ILDR2Q71H61 639 aa8.18□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 MRS2Q9HD23 443 aa8.18□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa8.18□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 NINLQ9Y2I6 1382 aa8.18□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa8.18□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 ADAMTSL3P82987 1691 aa8.18□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 NLRP13Q86W25 1043 aa8.17□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 EVC2Q86UK5 1308 aa8.17□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.17□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 METP08581 1390 aa8.16□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.16□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 KNDC1Q76NI1 1749 aa8.16□□□□□ -1.1
C6orf48-208ENST00000395788 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.16□□□□□ -1.1
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