RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 E9PSI1 815 aa9.1□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 PTMSP20962 102 aa9.1□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 TECPR2O15040 1411 aa9.09□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 RFX1P22670 979 aa9.09□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 ANKLE2Q86XL3 938 aa9.09□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 BANK1Q8NDB2 785 aa9.09□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa9.09□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 GLMNQ92990 594 aa9.09□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 KNSTRNQ9Y448 316 aa9.09□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 TBX22Q9Y458 520 aa9.09□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 MED14O60244 1454 aa9.09□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 EVC2Q86UK5 1308 aa9.09□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 FAM135BQ49AJ0 1406 aa9.09□□□□□ -0.95
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CTPS1-201ENST00000372616 SOCS7O14512 581 aa9.09□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 RRP9O43818 475 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFV2P19404 249 aa9.09□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 LTKP29376 864 aa9.09□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 SLFN5Q08AF3 891 aa9.09□□□□□ -0.95
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CTPS1-201ENST00000372616 PANK3Q9H999 370 aa9.09□□□□□ -0.95
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CTPS1-201ENST00000372616 PIK3R4Q99570 1358 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 CPS1P31327 1500 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 AP1G2O75843 785 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 SLC34A2O95436 690 aa9.07□□□□□ -0.96
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CTPS1-201ENST00000372616 RGS22Q8NE09 1264 aa9.07□□□□□ -0.96
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CTPS1-201ENST00000372616 STK26Q9P289 416 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 MOXD2PA6NHM9 499 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 SLC4A3P48751 1232 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 METP08581 1390 aa9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 RGS3P49796 1198 aa9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 C20orf194Q5TEA3 1177 aa9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 PPP2R1AP30153 589 aa9.05□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 MRE11P49959 708 aa9.05□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 PRAM1Q96QH2 718 aa9.05□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 MYOM1P52179 1685 aa9.05□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.05□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.05□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 C3orf80F5H4A9 247 aa9.05□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.05□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.05□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.04□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.04□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 TULP4Q9NRJ4 1543 aa9.04□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 PTCH1Q13635 1447 aa9.04□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.04□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 FBXW7Q969H0 707 aa9.04□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.03□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 FSD2A1L4K1 749 aa9.03□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 RCCD1A6NED2 376 aa9.03□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 CANXP27824 592 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 FOSBP53539 338 aa9.03□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 TTC13Q8NBP0 860 aa9.03□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.03□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 ANTXR1Q9H6X2 564 aa9.03□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.96
CTPS1-201ENST00000372616 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.02□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.02□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 SLC26A8Q96RN1 970 aa9.02□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 CHMP5Q9NZZ3 219 aa9.02□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRB2O60241 1585 aa9.02□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 USP19O94966 1318 aa9.02□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 PRSS12P56730 875 aa9.02□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.02□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 NUTM1Q86Y26 1132 aa9.01□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 PKNOX2Q96KN3 472 aa9.01□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.01□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 TPM2P07951 284 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 NUDT7P0C024 238 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 CD46P15529 392 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 MCM4P33991 863 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 DIXDC1Q155Q3 683 aa9□□□□□ -0.97
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