RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 IGHA1P01876 353 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 FOXK2Q01167 660 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 IRF5Q13568 498 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 ESCO1Q5FWF5 840 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 THBS1P07996 1170 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 USP4Q13107 963 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 GNASQ5JWF2 1037 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 MAP2K3P46734 347 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 PHKA2P46019 1235 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 C4orf17Q53FE4 359 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 RNF135Q8IUD6 432 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 NEDD1Q8NHV4 660 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 SIRT1Q96EB6 747 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 GPAMQ9HCL2 828 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 PHF24Q9UPV7 400 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 OIP5O43482 229 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 GPAT2Q6NUI2 795 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 PODNQ7Z5L7 613 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 MSX1P28360 303 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 VAC14Q08AM6 782 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 TLR1Q15399 786 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 WASHC4Q2M389 1173 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 PGBD3Q8N328 593 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-202ENST00000368205 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 EFHC2Q5JST6 749 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 KLRG1Q96E93 195 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 DCAF5Q96JK2 942 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 RUBCNLQ9H714 662 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 SCNN1DP51172 638 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 INHAP05111 366 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 SOX11P35716 441 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 ABL2P42684 1182 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 GDF10P55107 478 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 GALNT6Q8NCL4 622 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 ABHD17AQ96GS6 310 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRK-202ENST00000368205 BNIP3LO60238 219 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 ITGB2P05107 769 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 FGFR3P22607 806 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 PLA2G4AP47712 749 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 SEMA3FQ13275 785 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 MCM6Q14566 821 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 FIGNL1Q6PIW4 674 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 C2CD2LO14523 706 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 MSTNO14793 375 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 BMP4P12644 408 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 ATP4AP20648 1035 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 SMTNP53814 917 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 NLRP8Q86W28 1048 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 MTFR1Q15390 333 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 CTBSQ01459 385 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 SPOCK3Q9BQ16 436 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 CDK2AP1O14519 115 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 PROCP04070 461 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 ARAFP10398 606 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.7 ms