RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 TLR1Q15399 786 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00528Q8N1L1 170 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-78P-201ENST00000362897 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNKSR1Q969H4 720 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-78P-201ENST00000362897 NLRP3Q96P20 1036 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1W2PRU2 124 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRMT3O60678 531 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-78P-201ENST00000362897 BRD1O95696 1058 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP2B4P23634 1241 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTC1Q2NKJ3 1217 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCTD17Q8N5Z5 321 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-78P-201ENST00000362897 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-78P-201ENST00000362897 LGR5O75473 907 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 BMP2P12643 396 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 BMP1P13497 986 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCARF1Q14162 830 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 C6orf118Q5T5N4 469 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 TNS4Q8IZW8 715 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 NBPF15Q8N660 670 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 XAGE2Q96GT9 111 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC4A9Q96Q91 983 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 A6NJY4 79 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 AXIN1O15169 862 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPINT1O43278 529 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMTNP53814 917 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 EPHA4P54764 986 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 AEBP1Q8IUX7 1158 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC9A9Q8IVB4 645 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRIMPOLQ96LW4 560 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLAIN2Q9P270 581 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZBTB7CA1YPR0 619 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGFBP4P22692 258 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 SSFA2P28290 1259 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 WEE1P30291 646 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPC1P35052 558 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXK2Q01167 660 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 CENPCQ03188 943 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNA1Q09470 495 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTFR1Q15390 333 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 OCLNQ16625 522 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC27A3Q5K4L6 730 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRIPAKQ8N1N5 446 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 HRH3Q9Y5N1 445 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXO3O43524 673 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 GNASQ5JWF2 1037 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBCELQ5QJ74 424 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM46Q7Z4K8 759 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 VTI1AQ96AJ9 217 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHMP3Q9Y3E7 222 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDK2AP1O14519 115 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 ST8SIA5O15466 376 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAS2L2Q8NHY3 880 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1orf216Q8TAB5 229 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 RHBDD1Q8TEB9 315 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 MKNK1Q9BUB5 465 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTMR7Q9Y216 660 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP3Q9Y6I4 520 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATAD2Q6PL18 1390 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTLL8A6PVC2 850 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 C21orf2O43822 256 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF217Q8TC41 542 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRIP2Q9C0E4 1043 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 AAASQ9NRG9 546 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 CABP1Q9NZU7 370 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF232Q9UNY5 417 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-78P-201ENST00000362897 SERTM1A2A2V5 107 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLA2G4AP47712 749 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms