RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FOXF1Q12946 379 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT71Q3SY84 523 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MORN1Q5T089 497 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LHX8Q68G74 356 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q8N3U1 123 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SZT2Q5T011 3432 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LAMB2P55268 1798 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LTBP3Q9NS15 1303 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MT1BP07438 61 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POTEJP0CG39 1038 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AZU1P20160 251 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EGR4Q05215 589 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPATA3Q8NHX4 192 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FEZF2Q8TBJ5 459 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CXXC4Q9H2H0 198 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SDF2L1Q9HCN8 221 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RTTNQ86VV8 2226 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL24A1Q17RW2 1714 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HMX2A2RU54 273 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WIPF3A6NGB9 483 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RTL8CO15255 209 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ITGB3P05106 788 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARL14EPLP0DKL9 152 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIR3DL1P43629 444 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIR3DS1Q14943 382 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TJAP1Q5JTD0 557 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POTEEQ6S8J3 1075 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPNS2Q8IVW8 549 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEFF1Q8IYR6 380 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHRDL1Q9BU40 450 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q9UF83 564 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KLF15Q9UIH9 416 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CFAP54Q96N23 3096 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPG11Q96JI7 2443 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KMT2EQ8IZD2 1858 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C6P13671 934 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ISM2Q6H9L7 571 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF575Q86XF7 245 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCUBE3Q8IX30 993 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VCPIP1Q96JH7 1222 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WNT10AQ9GZT5 417 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LTBP1Q14766 1721 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WIPF1O43516 503 aa-1.82□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HRO43593 1189 aa-1.82□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CBFA2T3O75081 653 aa-1.82□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ITGB6P18564 788 aa-1.82□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP-1.82□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NDPQ00604 133 aa-1.82□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ASPHQ12797 758 aa-1.82□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa-1.82□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STK17AQ9UEE5 414 aa-1.82□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMARCA4P51532 1647 aa-1.82□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-1.82□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-1.82□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ASTN1O14525 1302 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CACNA1DQ01668 2161 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NFATC4Q14934 902 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HFE2Q6ZVN8 426 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CBLL1Q75N03 491 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OSCARQ8IYS5 282 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLCO2A1Q92959 643 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IRF7Q92985 503 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CFAP44Q96MT7 982 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FREM2Q5SZK8 3169 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLSCR5A0PG75 271 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EFEMP2O95967 443 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGHG3P01860 377 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GPR150Q8NGU9 434 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF414Q96IQ9 312 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADAM30Q9UKF2 790 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL4A1P02462 1669 aa-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LMTK3Q96Q04 1460 aa-1.85□□□□□ -2.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms