RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 CDKL5O76039 1030 aa24.86■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 KRT32Q14532 448 aa24.86■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 AK7Q96M32 723 aa24.86■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.85■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 FAM83GA6ND36 823 aa24.84■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 FBLN1P23142 703 aa24.84■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.83■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.83■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC83Q8IWF9 413 aa24.83■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.83■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 ZPR1O75312 459 aa24.82■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 IGHDP01880 384 aa24.82■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM27P14373 513 aa24.81■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.81■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.81■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.81■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.8■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 ACEP12821 1306 aa24.8■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 ACBD3Q9H3P7 528 aa24.8■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.567e-7■■■■■ 80
SMURF1-201ENST00000361125 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 DACH1Q9UI36 760 aa24.79■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 USP5P45974 858 aa24.79■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.79■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 CFAP45Q9UL16 551 aa24.79■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.79■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 SKIDA1Q1XH10 827 aa24.78■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 MBIPQ9NS73 344 aa24.78■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 FLIIQ13045 1269 aa24.78■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 HYPKQ9NX55 129 aa24.78■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 STIM1Q13586 685 aa24.78■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.78■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 HSP90B2PQ58FF3 399 aa24.77■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 FERMT3Q86UX7 667 aa24.77■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.77■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 SYCP1Q15431 976 aa24.77■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 PPFIBP1Q86W92 1011 aa24.77■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.77■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 NUP62CLQ9H1M0 184 aa24.77■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 GPTP24298 496 aa24.77■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.77■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SMURF1-201ENST00000361125 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.76■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 CCP110O43303 1012 aa24.76■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 CAMK4Q16566 473 aa24.76■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.75■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 A0A087WZG4 1122 aa24.75■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.75■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 NSD2O96028 1365 aa24.75■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 UQCRHLA0A096LP55 91 aa24.75■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 UQCRHP07919 91 aa24.75■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 WASF1Q92558 559 aa24.75■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 PTPRCP08575 1304 aa24.74■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 SYCE3A1L190 88 aa24.74■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 CDR1P51861 262 aa24.73■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.73■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.73■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF76P36508 570 aa24.73■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 CHRNA2Q15822 529 aa24.73■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.72■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.72■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 DEF6Q9H4E7 631 aa24.72■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.72■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 CEP57L1Q8IYX8 460 aa24.71■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 NAPBQ9H115 298 aa24.71■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.71■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.71■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 SSFA2P28290 1259 aa24.71■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 EXOC5O00471 708 aa24.7■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 SLC5A1P13866 664 aa24.7■■□□□ 1.55
SMURF1-201ENST00000361125 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.7■■□□□ 1.54
SMURF1-201ENST00000361125 GUCY1B3Q02153 619 aa24.7■■□□□ 1.54
SMURF1-201ENST00000361125 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SMURF1-201ENST00000361125 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.69■■□□□ 1.54
SMURF1-201ENST00000361125 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.69■■□□□ 1.54
SMURF1-201ENST00000361125 TNRQ92752 1358 aa24.69■■□□□ 1.54
SMURF1-201ENST00000361125 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.69■■□□□ 1.54
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