RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP5.76□□□□□ -1.49
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PTPRD-201ENST00000355233 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-201ENST00000355233 VSIG10Q8N0Z9 540 aa5.75□□□□□ -1.49
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
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PTPRD-201ENST00000355233 JAKMIP2Q96AA8 810 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRD-201ENST00000355233 AOX1Q06278 1338 aa5.72□□□□□ -1.49
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PTPRD-201ENST00000355233 CFAP70Q5T0N1 1121 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD45Q5TZF3 282 aa5.72□□□□□ -1.49
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